Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Q8

Colec12, Collectin-12, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec12Q8K4Q8 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Colec12Q8K4Q8 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Colec12Q8K4Q8 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Colec12Q8K4Q8 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Colec12Q8K4Q8 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Colec12Q8K4Q8 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Colec12Q8K4Q8 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Colec12Q8K4Q8 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Colec12Q8K4Q8 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Colec12Q8K4Q8 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Colec12Q8K4Q8 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Colec12Q8K4Q8 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Colec12Q8K4Q8 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Colec12Q8K4Q8 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Colec12Q8K4Q8 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Colec12Q8K4Q8 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Colec12Q8K4Q8 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Colec12Q8K4Q8 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Colec12Q8K4Q8 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Colec12Q8K4Q8 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Colec12Q8K4Q8 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Colec12Q8K4Q8 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Colec12Q8K4Q8 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Colec12Q8K4Q8 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Colec12Q8K4Q8 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Colec12Q8K4Q8 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Colec12Q8K4Q8 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Colec12Q8K4Q8 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Colec12Q8K4Q8 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Colec12Q8K4Q8 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Colec12Q8K4Q8 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Colec12Q8K4Q8 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Colec12Q8K4Q8 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Colec12Q8K4Q8 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Colec12Q8K4Q8 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Colec12Q8K4Q8 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Colec12Q8K4Q8 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Colec12Q8K4Q8 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Colec12Q8K4Q8 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Colec12Q8K4Q8 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Colec12Q8K4Q8 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Colec12Q8K4Q8 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Colec12Q8K4Q8 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Colec12Q8K4Q8 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Colec12Q8K4Q8 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Colec12Q8K4Q8 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Colec12Q8K4Q8 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Colec12Q8K4Q8 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Colec12Q8K4Q8 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Colec12Q8K4Q8 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Colec12Q8K4Q8 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Colec12Q8K4Q8 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Colec12Q8K4Q8 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Colec12Q8K4Q8 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Colec12Q8K4Q8 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Colec12Q8K4Q8 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Colec12Q8K4Q8 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Colec12Q8K4Q8 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Colec12Q8K4Q8 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Colec12Q8K4Q8 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Colec12Q8K4Q8 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Colec12Q8K4Q8 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Colec12Q8K4Q8 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Colec12Q8K4Q8 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Colec12Q8K4Q8 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Colec12Q8K4Q8 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Colec12Q8K4Q8 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Colec12Q8K4Q8 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Colec12Q8K4Q8 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Colec12Q8K4Q8 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Colec12Q8K4Q8 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Colec12Q8K4Q8 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Colec12Q8K4Q8 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Colec12Q8K4Q8 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Colec12Q8K4Q8 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Colec12Q8K4Q8 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Colec12Q8K4Q8 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Colec12Q8K4Q8 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Colec12Q8K4Q8 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Colec12Q8K4Q8 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Colec12Q8K4Q8 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Colec12Q8K4Q8 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Colec12Q8K4Q8 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Colec12Q8K4Q8 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Colec12Q8K4Q8 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Colec12Q8K4Q8 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Colec12Q8K4Q8 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Colec12Q8K4Q8 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Colec12Q8K4Q8 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Colec12Q8K4Q8 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Colec12Q8K4Q8 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Colec12Q8K4Q8 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Colec12Q8K4Q8 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Colec12Q8K4Q8 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Colec12Q8K4Q8 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Colec12Q8K4Q8 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Colec12Q8K4Q8 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Colec12Q8K4Q8 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Colec12Q8K4Q8 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Colec12Q8K4Q8 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms