Protein–RNA interactions for Protein: Q8K409

Polb, DNA polymerase beta, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolbQ8K409 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PolbQ8K409 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PolbQ8K409 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PolbQ8K409 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PolbQ8K409 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PolbQ8K409 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PolbQ8K409 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PolbQ8K409 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PolbQ8K409 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PolbQ8K409 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PolbQ8K409 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PolbQ8K409 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PolbQ8K409 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PolbQ8K409 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PolbQ8K409 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PolbQ8K409 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PolbQ8K409 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PolbQ8K409 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PolbQ8K409 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PolbQ8K409 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PolbQ8K409 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PolbQ8K409 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PolbQ8K409 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PolbQ8K409 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PolbQ8K409 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PolbQ8K409 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PolbQ8K409 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PolbQ8K409 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PolbQ8K409 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PolbQ8K409 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PolbQ8K409 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PolbQ8K409 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PolbQ8K409 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PolbQ8K409 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PolbQ8K409 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PolbQ8K409 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PolbQ8K409 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PolbQ8K409 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PolbQ8K409 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PolbQ8K409 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PolbQ8K409 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PolbQ8K409 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PolbQ8K409 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PolbQ8K409 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PolbQ8K409 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PolbQ8K409 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PolbQ8K409 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PolbQ8K409 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PolbQ8K409 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PolbQ8K409 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PolbQ8K409 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PolbQ8K409 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PolbQ8K409 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PolbQ8K409 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PolbQ8K409 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PolbQ8K409 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PolbQ8K409 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PolbQ8K409 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PolbQ8K409 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PolbQ8K409 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PolbQ8K409 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PolbQ8K409 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PolbQ8K409 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PolbQ8K409 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PolbQ8K409 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PolbQ8K409 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PolbQ8K409 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PolbQ8K409 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PolbQ8K409 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PolbQ8K409 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PolbQ8K409 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PolbQ8K409 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PolbQ8K409 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PolbQ8K409 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PolbQ8K409 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PolbQ8K409 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PolbQ8K409 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PolbQ8K409 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PolbQ8K409 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PolbQ8K409 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PolbQ8K409 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PolbQ8K409 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PolbQ8K409 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PolbQ8K409 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PolbQ8K409 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PolbQ8K409 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PolbQ8K409 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PolbQ8K409 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PolbQ8K409 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PolbQ8K409 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PolbQ8K409 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PolbQ8K409 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PolbQ8K409 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PolbQ8K409 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PolbQ8K409 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PolbQ8K409 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PolbQ8K409 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PolbQ8K409 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PolbQ8K409 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PolbQ8K409 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms