Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3Y3

Lin28a, Protein lin-28 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin28aQ8K3Y3 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lin28aQ8K3Y3 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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