Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3V1

Spata4, Spermatogenesis-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata4Q8K3V1 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spata4Q8K3V1 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spata4Q8K3V1 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spata4Q8K3V1 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spata4Q8K3V1 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spata4Q8K3V1 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spata4Q8K3V1 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spata4Q8K3V1 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spata4Q8K3V1 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spata4Q8K3V1 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spata4Q8K3V1 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spata4Q8K3V1 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spata4Q8K3V1 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spata4Q8K3V1 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spata4Q8K3V1 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spata4Q8K3V1 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spata4Q8K3V1 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spata4Q8K3V1 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spata4Q8K3V1 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spata4Q8K3V1 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spata4Q8K3V1 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spata4Q8K3V1 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spata4Q8K3V1 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spata4Q8K3V1 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spata4Q8K3V1 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spata4Q8K3V1 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spata4Q8K3V1 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spata4Q8K3V1 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spata4Q8K3V1 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spata4Q8K3V1 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spata4Q8K3V1 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spata4Q8K3V1 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spata4Q8K3V1 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spata4Q8K3V1 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spata4Q8K3V1 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spata4Q8K3V1 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spata4Q8K3V1 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spata4Q8K3V1 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spata4Q8K3V1 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spata4Q8K3V1 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spata4Q8K3V1 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spata4Q8K3V1 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spata4Q8K3V1 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spata4Q8K3V1 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spata4Q8K3V1 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spata4Q8K3V1 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spata4Q8K3V1 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spata4Q8K3V1 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spata4Q8K3V1 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spata4Q8K3V1 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spata4Q8K3V1 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spata4Q8K3V1 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spata4Q8K3V1 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spata4Q8K3V1 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spata4Q8K3V1 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spata4Q8K3V1 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spata4Q8K3V1 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spata4Q8K3V1 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spata4Q8K3V1 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spata4Q8K3V1 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spata4Q8K3V1 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Spata4Q8K3V1 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spata4Q8K3V1 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spata4Q8K3V1 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spata4Q8K3V1 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spata4Q8K3V1 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spata4Q8K3V1 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spata4Q8K3V1 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spata4Q8K3V1 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spata4Q8K3V1 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spata4Q8K3V1 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spata4Q8K3V1 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spata4Q8K3V1 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spata4Q8K3V1 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spata4Q8K3V1 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spata4Q8K3V1 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spata4Q8K3V1 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spata4Q8K3V1 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spata4Q8K3V1 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spata4Q8K3V1 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spata4Q8K3V1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spata4Q8K3V1 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spata4Q8K3V1 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spata4Q8K3V1 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spata4Q8K3V1 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Spata4Q8K3V1 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spata4Q8K3V1 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Spata4Q8K3V1 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Spata4Q8K3V1 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Spata4Q8K3V1 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Spata4Q8K3V1 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spata4Q8K3V1 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spata4Q8K3V1 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spata4Q8K3V1 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spata4Q8K3V1 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spata4Q8K3V1 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spata4Q8K3V1 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spata4Q8K3V1 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spata4Q8K3V1 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spata4Q8K3V1 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms