Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssh3Q8K330 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssh3Q8K330 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssh3Q8K330 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssh3Q8K330 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssh3Q8K330 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssh3Q8K330 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssh3Q8K330 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ssh3Q8K330 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ssh3Q8K330 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ssh3Q8K330 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ssh3Q8K330 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssh3Q8K330 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssh3Q8K330 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssh3Q8K330 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssh3Q8K330 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssh3Q8K330 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssh3Q8K330 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssh3Q8K330 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssh3Q8K330 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssh3Q8K330 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssh3Q8K330 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssh3Q8K330 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssh3Q8K330 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssh3Q8K330 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssh3Q8K330 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssh3Q8K330 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssh3Q8K330 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssh3Q8K330 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssh3Q8K330 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssh3Q8K330 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssh3Q8K330 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssh3Q8K330 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssh3Q8K330 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssh3Q8K330 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssh3Q8K330 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssh3Q8K330 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssh3Q8K330 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssh3Q8K330 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssh3Q8K330 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssh3Q8K330 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssh3Q8K330 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssh3Q8K330 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssh3Q8K330 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssh3Q8K330 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Ssh3Q8K330 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssh3Q8K330 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssh3Q8K330 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssh3Q8K330 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssh3Q8K330 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssh3Q8K330 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssh3Q8K330 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssh3Q8K330 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssh3Q8K330 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Ssh3Q8K330 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ssh3Q8K330 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Ssh3Q8K330 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Ssh3Q8K330 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssh3Q8K330 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Ssh3Q8K330 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssh3Q8K330 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssh3Q8K330 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssh3Q8K330 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Ssh3Q8K330 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssh3Q8K330 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssh3Q8K330 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssh3Q8K330 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ssh3Q8K330 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssh3Q8K330 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssh3Q8K330 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssh3Q8K330 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssh3Q8K330 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssh3Q8K330 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssh3Q8K330 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssh3Q8K330 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssh3Q8K330 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssh3Q8K330 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssh3Q8K330 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssh3Q8K330 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssh3Q8K330 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssh3Q8K330 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssh3Q8K330 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssh3Q8K330 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssh3Q8K330 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssh3Q8K330 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssh3Q8K330 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssh3Q8K330 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssh3Q8K330 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssh3Q8K330 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssh3Q8K330 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssh3Q8K330 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ssh3Q8K330 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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