Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Y7

Mrpl47, 39S ribosomal protein L47, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl47Q8K2Y7 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mrpl47Q8K2Y7 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mrpl47Q8K2Y7 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mrpl47Q8K2Y7 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Mrpl47Q8K2Y7 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mrpl47Q8K2Y7 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mrpl47Q8K2Y7 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mrpl47Q8K2Y7 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mrpl47Q8K2Y7 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mrpl47Q8K2Y7 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mrpl47Q8K2Y7 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mrpl47Q8K2Y7 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mrpl47Q8K2Y7 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mrpl47Q8K2Y7 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mrpl47Q8K2Y7 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mrpl47Q8K2Y7 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mrpl47Q8K2Y7 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mrpl47Q8K2Y7 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mrpl47Q8K2Y7 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mrpl47Q8K2Y7 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mrpl47Q8K2Y7 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mrpl47Q8K2Y7 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mrpl47Q8K2Y7 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mrpl47Q8K2Y7 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mrpl47Q8K2Y7 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mrpl47Q8K2Y7 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mrpl47Q8K2Y7 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mrpl47Q8K2Y7 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mrpl47Q8K2Y7 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mrpl47Q8K2Y7 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mrpl47Q8K2Y7 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mrpl47Q8K2Y7 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mrpl47Q8K2Y7 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mrpl47Q8K2Y7 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mrpl47Q8K2Y7 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mrpl47Q8K2Y7 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mrpl47Q8K2Y7 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mrpl47Q8K2Y7 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mrpl47Q8K2Y7 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mrpl47Q8K2Y7 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mrpl47Q8K2Y7 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mrpl47Q8K2Y7 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mrpl47Q8K2Y7 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mrpl47Q8K2Y7 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mrpl47Q8K2Y7 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mrpl47Q8K2Y7 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mrpl47Q8K2Y7 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mrpl47Q8K2Y7 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mrpl47Q8K2Y7 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mrpl47Q8K2Y7 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mrpl47Q8K2Y7 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mrpl47Q8K2Y7 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mrpl47Q8K2Y7 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mrpl47Q8K2Y7 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mrpl47Q8K2Y7 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mrpl47Q8K2Y7 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mrpl47Q8K2Y7 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mrpl47Q8K2Y7 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mrpl47Q8K2Y7 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mrpl47Q8K2Y7 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mrpl47Q8K2Y7 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mrpl47Q8K2Y7 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms