Protein–RNA interactions for Protein: Q8K202

Polr1e, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1eQ8K202 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Polr1eQ8K202 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Polr1eQ8K202 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Polr1eQ8K202 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Polr1eQ8K202 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Polr1eQ8K202 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Polr1eQ8K202 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Polr1eQ8K202 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Polr1eQ8K202 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Polr1eQ8K202 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Polr1eQ8K202 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Polr1eQ8K202 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Polr1eQ8K202 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Polr1eQ8K202 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Polr1eQ8K202 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Polr1eQ8K202 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Polr1eQ8K202 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Polr1eQ8K202 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Polr1eQ8K202 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Polr1eQ8K202 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Polr1eQ8K202 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Polr1eQ8K202 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Polr1eQ8K202 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Polr1eQ8K202 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Polr1eQ8K202 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Polr1eQ8K202 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Polr1eQ8K202 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Polr1eQ8K202 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Polr1eQ8K202 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Polr1eQ8K202 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Polr1eQ8K202 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Polr1eQ8K202 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Polr1eQ8K202 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Polr1eQ8K202 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Polr1eQ8K202 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Polr1eQ8K202 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Polr1eQ8K202 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Polr1eQ8K202 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Polr1eQ8K202 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Polr1eQ8K202 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Polr1eQ8K202 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Polr1eQ8K202 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Polr1eQ8K202 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Polr1eQ8K202 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Polr1eQ8K202 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Polr1eQ8K202 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Polr1eQ8K202 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Polr1eQ8K202 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Polr1eQ8K202 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Polr1eQ8K202 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Polr1eQ8K202 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Polr1eQ8K202 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Polr1eQ8K202 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Polr1eQ8K202 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Polr1eQ8K202 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Polr1eQ8K202 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Polr1eQ8K202 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Polr1eQ8K202 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Polr1eQ8K202 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Polr1eQ8K202 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Polr1eQ8K202 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Polr1eQ8K202 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Polr1eQ8K202 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Polr1eQ8K202 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Polr1eQ8K202 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Polr1eQ8K202 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Polr1eQ8K202 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Polr1eQ8K202 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Polr1eQ8K202 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Polr1eQ8K202 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Polr1eQ8K202 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Polr1eQ8K202 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Polr1eQ8K202 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Polr1eQ8K202 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Polr1eQ8K202 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Polr1eQ8K202 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Polr1eQ8K202 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Polr1eQ8K202 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Polr1eQ8K202 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Polr1eQ8K202 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Polr1eQ8K202 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Polr1eQ8K202 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Polr1eQ8K202 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Polr1eQ8K202 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Polr1eQ8K202 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Polr1eQ8K202 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Polr1eQ8K202 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Polr1eQ8K202 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Polr1eQ8K202 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Polr1eQ8K202 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Polr1eQ8K202 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Polr1eQ8K202 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Polr1eQ8K202 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr1eQ8K202 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr1eQ8K202 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr1eQ8K202 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr1eQ8K202 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr1eQ8K202 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr1eQ8K202 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr1eQ8K202 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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