Protein–RNA interactions for Protein: Q8K193

Cldn34c1, Claudin 34C1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c1Q8K193 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Cldn34c1Q8K193 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn34c1Q8K193 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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