Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0V4

Cnot3, CCR4-NOT transcription complex subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot3Q8K0V4 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot3Q8K0V4 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms