Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH19

Csnka2ip, Casein kinase II subunit alpha'-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnka2ipQ8CH19 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csnka2ipQ8CH19 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csnka2ipQ8CH19 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csnka2ipQ8CH19 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csnka2ipQ8CH19 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csnka2ipQ8CH19 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csnka2ipQ8CH19 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csnka2ipQ8CH19 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csnka2ipQ8CH19 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csnka2ipQ8CH19 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csnka2ipQ8CH19 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csnka2ipQ8CH19 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csnka2ipQ8CH19 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csnka2ipQ8CH19 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csnka2ipQ8CH19 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csnka2ipQ8CH19 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csnka2ipQ8CH19 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csnka2ipQ8CH19 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csnka2ipQ8CH19 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csnka2ipQ8CH19 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csnka2ipQ8CH19 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csnka2ipQ8CH19 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Csnka2ipQ8CH19 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csnka2ipQ8CH19 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csnka2ipQ8CH19 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csnka2ipQ8CH19 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csnka2ipQ8CH19 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csnka2ipQ8CH19 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csnka2ipQ8CH19 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csnka2ipQ8CH19 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csnka2ipQ8CH19 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csnka2ipQ8CH19 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csnka2ipQ8CH19 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csnka2ipQ8CH19 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csnka2ipQ8CH19 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csnka2ipQ8CH19 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csnka2ipQ8CH19 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csnka2ipQ8CH19 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csnka2ipQ8CH19 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csnka2ipQ8CH19 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csnka2ipQ8CH19 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csnka2ipQ8CH19 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csnka2ipQ8CH19 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csnka2ipQ8CH19 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csnka2ipQ8CH19 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csnka2ipQ8CH19 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csnka2ipQ8CH19 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csnka2ipQ8CH19 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csnka2ipQ8CH19 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csnka2ipQ8CH19 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csnka2ipQ8CH19 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csnka2ipQ8CH19 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csnka2ipQ8CH19 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csnka2ipQ8CH19 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csnka2ipQ8CH19 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Csnka2ipQ8CH19 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csnka2ipQ8CH19 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csnka2ipQ8CH19 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csnka2ipQ8CH19 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csnka2ipQ8CH19 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csnka2ipQ8CH19 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csnka2ipQ8CH19 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csnka2ipQ8CH19 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csnka2ipQ8CH19 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csnka2ipQ8CH19 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csnka2ipQ8CH19 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csnka2ipQ8CH19 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csnka2ipQ8CH19 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csnka2ipQ8CH19 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csnka2ipQ8CH19 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csnka2ipQ8CH19 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csnka2ipQ8CH19 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Csnka2ipQ8CH19 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Csnka2ipQ8CH19 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Csnka2ipQ8CH19 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csnka2ipQ8CH19 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csnka2ipQ8CH19 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csnka2ipQ8CH19 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csnka2ipQ8CH19 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csnka2ipQ8CH19 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csnka2ipQ8CH19 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csnka2ipQ8CH19 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csnka2ipQ8CH19 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Csnka2ipQ8CH19 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Csnka2ipQ8CH19 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Csnka2ipQ8CH19 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Csnka2ipQ8CH19 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Csnka2ipQ8CH19 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Csnka2ipQ8CH19 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Csnka2ipQ8CH19 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Csnka2ipQ8CH19 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Csnka2ipQ8CH19 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Csnka2ipQ8CH19 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Csnka2ipQ8CH19 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Csnka2ipQ8CH19 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Csnka2ipQ8CH19 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Csnka2ipQ8CH19 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Csnka2ipQ8CH19 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Csnka2ipQ8CH19 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csnka2ipQ8CH19 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms