Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGF7

Tcerg1, Transcription elongation regulator 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,100 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcerg1Q8CGF7 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tcerg1Q8CGF7 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tcerg1Q8CGF7 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Tcerg1Q8CGF7 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tcerg1Q8CGF7 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tcerg1Q8CGF7 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Tcerg1Q8CGF7 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tcerg1Q8CGF7 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tcerg1Q8CGF7 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tcerg1Q8CGF7 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Tcerg1Q8CGF7 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tcerg1Q8CGF7 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tcerg1Q8CGF7 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tcerg1Q8CGF7 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tcerg1Q8CGF7 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tcerg1Q8CGF7 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tcerg1Q8CGF7 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tcerg1Q8CGF7 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Tcerg1Q8CGF7 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tcerg1Q8CGF7 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tcerg1Q8CGF7 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tcerg1Q8CGF7 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tcerg1Q8CGF7 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tcerg1Q8CGF7 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tcerg1Q8CGF7 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tcerg1Q8CGF7 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tcerg1Q8CGF7 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tcerg1Q8CGF7 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tcerg1Q8CGF7 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tcerg1Q8CGF7 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tcerg1Q8CGF7 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tcerg1Q8CGF7 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tcerg1Q8CGF7 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tcerg1Q8CGF7 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tcerg1Q8CGF7 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Tcerg1Q8CGF7 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Tcerg1Q8CGF7 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tcerg1Q8CGF7 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tcerg1Q8CGF7 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tcerg1Q8CGF7 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tcerg1Q8CGF7 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tcerg1Q8CGF7 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tcerg1Q8CGF7 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tcerg1Q8CGF7 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Tcerg1Q8CGF7 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tcerg1Q8CGF7 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tcerg1Q8CGF7 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tcerg1Q8CGF7 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tcerg1Q8CGF7 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Tcerg1Q8CGF7 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Tcerg1Q8CGF7 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tcerg1Q8CGF7 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tcerg1Q8CGF7 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tcerg1Q8CGF7 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tcerg1Q8CGF7 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tcerg1Q8CGF7 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tcerg1Q8CGF7 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tcerg1Q8CGF7 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tcerg1Q8CGF7 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tcerg1Q8CGF7 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tcerg1Q8CGF7 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tcerg1Q8CGF7 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tcerg1Q8CGF7 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tcerg1Q8CGF7 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tcerg1Q8CGF7 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tcerg1Q8CGF7 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tcerg1Q8CGF7 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tcerg1Q8CGF7 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Tcerg1Q8CGF7 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Tcerg1Q8CGF7 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tcerg1Q8CGF7 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tcerg1Q8CGF7 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tcerg1Q8CGF7 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tcerg1Q8CGF7 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tcerg1Q8CGF7 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tcerg1Q8CGF7 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tcerg1Q8CGF7 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tcerg1Q8CGF7 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tcerg1Q8CGF7 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Tcerg1Q8CGF7 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tcerg1Q8CGF7 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tcerg1Q8CGF7 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tcerg1Q8CGF7 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tcerg1Q8CGF7 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tcerg1Q8CGF7 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tcerg1Q8CGF7 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tcerg1Q8CGF7 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tcerg1Q8CGF7 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tcerg1Q8CGF7 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tcerg1Q8CGF7 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tcerg1Q8CGF7 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tcerg1Q8CGF7 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tcerg1Q8CGF7 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tcerg1Q8CGF7 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tcerg1Q8CGF7 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tcerg1Q8CGF7 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tcerg1Q8CGF7 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tcerg1Q8CGF7 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tcerg1Q8CGF7 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tcerg1Q8CGF7 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
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