Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFT2

Setd1b, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd1bQ8CFT2 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Setd1bQ8CFT2 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Setd1bQ8CFT2 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Setd1bQ8CFT2 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Setd1bQ8CFT2 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Setd1bQ8CFT2 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Setd1bQ8CFT2 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Setd1bQ8CFT2 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Setd1bQ8CFT2 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Setd1bQ8CFT2 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Setd1bQ8CFT2 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Setd1bQ8CFT2 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Setd1bQ8CFT2 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Setd1bQ8CFT2 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Setd1bQ8CFT2 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Setd1bQ8CFT2 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Setd1bQ8CFT2 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Setd1bQ8CFT2 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Setd1bQ8CFT2 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Setd1bQ8CFT2 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Setd1bQ8CFT2 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Setd1bQ8CFT2 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Setd1bQ8CFT2 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Setd1bQ8CFT2 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Setd1bQ8CFT2 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Setd1bQ8CFT2 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Setd1bQ8CFT2 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Setd1bQ8CFT2 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Setd1bQ8CFT2 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Setd1bQ8CFT2 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Setd1bQ8CFT2 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Setd1bQ8CFT2 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Setd1bQ8CFT2 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Setd1bQ8CFT2 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Setd1bQ8CFT2 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Setd1bQ8CFT2 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Setd1bQ8CFT2 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Setd1bQ8CFT2 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Setd1bQ8CFT2 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Setd1bQ8CFT2 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Setd1bQ8CFT2 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Setd1bQ8CFT2 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Setd1bQ8CFT2 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Setd1bQ8CFT2 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Setd1bQ8CFT2 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Setd1bQ8CFT2 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Setd1bQ8CFT2 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Setd1bQ8CFT2 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Setd1bQ8CFT2 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Setd1bQ8CFT2 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Setd1bQ8CFT2 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Setd1bQ8CFT2 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Setd1bQ8CFT2 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Setd1bQ8CFT2 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Setd1bQ8CFT2 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Setd1bQ8CFT2 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Setd1bQ8CFT2 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Setd1bQ8CFT2 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Setd1bQ8CFT2 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Setd1bQ8CFT2 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Setd1bQ8CFT2 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Setd1bQ8CFT2 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Setd1bQ8CFT2 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Setd1bQ8CFT2 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Setd1bQ8CFT2 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Setd1bQ8CFT2 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Setd1bQ8CFT2 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Setd1bQ8CFT2 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Setd1bQ8CFT2 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Setd1bQ8CFT2 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Setd1bQ8CFT2 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Setd1bQ8CFT2 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Setd1bQ8CFT2 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Setd1bQ8CFT2 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Setd1bQ8CFT2 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Setd1bQ8CFT2 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Setd1bQ8CFT2 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Setd1bQ8CFT2 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Setd1bQ8CFT2 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Setd1bQ8CFT2 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Setd1bQ8CFT2 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Setd1bQ8CFT2 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Setd1bQ8CFT2 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Setd1bQ8CFT2 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Setd1bQ8CFT2 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Setd1bQ8CFT2 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Setd1bQ8CFT2 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Setd1bQ8CFT2 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Setd1bQ8CFT2 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Setd1bQ8CFT2 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Setd1bQ8CFT2 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Setd1bQ8CFT2 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Setd1bQ8CFT2 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Setd1bQ8CFT2 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Setd1bQ8CFT2 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Setd1bQ8CFT2 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Setd1bQ8CFT2 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Setd1bQ8CFT2 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Setd1bQ8CFT2 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Setd1bQ8CFT2 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.3 ms