Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hpf1Q8CFE2 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hpf1Q8CFE2 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hpf1Q8CFE2 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hpf1Q8CFE2 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hpf1Q8CFE2 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hpf1Q8CFE2 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hpf1Q8CFE2 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Hpf1Q8CFE2 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Hpf1Q8CFE2 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hpf1Q8CFE2 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hpf1Q8CFE2 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hpf1Q8CFE2 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hpf1Q8CFE2 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hpf1Q8CFE2 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hpf1Q8CFE2 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hpf1Q8CFE2 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hpf1Q8CFE2 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hpf1Q8CFE2 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hpf1Q8CFE2 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hpf1Q8CFE2 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hpf1Q8CFE2 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hpf1Q8CFE2 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hpf1Q8CFE2 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hpf1Q8CFE2 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hpf1Q8CFE2 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hpf1Q8CFE2 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hpf1Q8CFE2 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hpf1Q8CFE2 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hpf1Q8CFE2 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hpf1Q8CFE2 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Hpf1Q8CFE2 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hpf1Q8CFE2 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Hpf1Q8CFE2 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hpf1Q8CFE2 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hpf1Q8CFE2 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Hpf1Q8CFE2 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hpf1Q8CFE2 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hpf1Q8CFE2 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hpf1Q8CFE2 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hpf1Q8CFE2 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hpf1Q8CFE2 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hpf1Q8CFE2 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hpf1Q8CFE2 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hpf1Q8CFE2 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hpf1Q8CFE2 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hpf1Q8CFE2 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hpf1Q8CFE2 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hpf1Q8CFE2 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hpf1Q8CFE2 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hpf1Q8CFE2 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hpf1Q8CFE2 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hpf1Q8CFE2 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hpf1Q8CFE2 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Hpf1Q8CFE2 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hpf1Q8CFE2 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hpf1Q8CFE2 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hpf1Q8CFE2 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hpf1Q8CFE2 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Hpf1Q8CFE2 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hpf1Q8CFE2 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Hpf1Q8CFE2 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hpf1Q8CFE2 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hpf1Q8CFE2 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hpf1Q8CFE2 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hpf1Q8CFE2 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hpf1Q8CFE2 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hpf1Q8CFE2 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hpf1Q8CFE2 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Hpf1Q8CFE2 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hpf1Q8CFE2 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hpf1Q8CFE2 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hpf1Q8CFE2 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Hpf1Q8CFE2 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hpf1Q8CFE2 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hpf1Q8CFE2 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hpf1Q8CFE2 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hpf1Q8CFE2 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hpf1Q8CFE2 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hpf1Q8CFE2 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hpf1Q8CFE2 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hpf1Q8CFE2 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hpf1Q8CFE2 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hpf1Q8CFE2 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hpf1Q8CFE2 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hpf1Q8CFE2 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hpf1Q8CFE2 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hpf1Q8CFE2 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hpf1Q8CFE2 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Hpf1Q8CFE2 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hpf1Q8CFE2 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hpf1Q8CFE2 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hpf1Q8CFE2 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hpf1Q8CFE2 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hpf1Q8CFE2 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hpf1Q8CFE2 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hpf1Q8CFE2 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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