Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE47

Slc49a3, Solute carrier family 49 member A3, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc49a3Q8CE47 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc49a3Q8CE47 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc49a3Q8CE47 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc49a3Q8CE47 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc49a3Q8CE47 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc49a3Q8CE47 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc49a3Q8CE47 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc49a3Q8CE47 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc49a3Q8CE47 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc49a3Q8CE47 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc49a3Q8CE47 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc49a3Q8CE47 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc49a3Q8CE47 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc49a3Q8CE47 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc49a3Q8CE47 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc49a3Q8CE47 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc49a3Q8CE47 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc49a3Q8CE47 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc49a3Q8CE47 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc49a3Q8CE47 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc49a3Q8CE47 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc49a3Q8CE47 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc49a3Q8CE47 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc49a3Q8CE47 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc49a3Q8CE47 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc49a3Q8CE47 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc49a3Q8CE47 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc49a3Q8CE47 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc49a3Q8CE47 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc49a3Q8CE47 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc49a3Q8CE47 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc49a3Q8CE47 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc49a3Q8CE47 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc49a3Q8CE47 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc49a3Q8CE47 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc49a3Q8CE47 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc49a3Q8CE47 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc49a3Q8CE47 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc49a3Q8CE47 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc49a3Q8CE47 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc49a3Q8CE47 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc49a3Q8CE47 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc49a3Q8CE47 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc49a3Q8CE47 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc49a3Q8CE47 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc49a3Q8CE47 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc49a3Q8CE47 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc49a3Q8CE47 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc49a3Q8CE47 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc49a3Q8CE47 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc49a3Q8CE47 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc49a3Q8CE47 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc49a3Q8CE47 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc49a3Q8CE47 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc49a3Q8CE47 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc49a3Q8CE47 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc49a3Q8CE47 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc49a3Q8CE47 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc49a3Q8CE47 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc49a3Q8CE47 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc49a3Q8CE47 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc49a3Q8CE47 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc49a3Q8CE47 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc49a3Q8CE47 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc49a3Q8CE47 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc49a3Q8CE47 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc49a3Q8CE47 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc49a3Q8CE47 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc49a3Q8CE47 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc49a3Q8CE47 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc49a3Q8CE47 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc49a3Q8CE47 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc49a3Q8CE47 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc49a3Q8CE47 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc49a3Q8CE47 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc49a3Q8CE47 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc49a3Q8CE47 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc49a3Q8CE47 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc49a3Q8CE47 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc49a3Q8CE47 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc49a3Q8CE47 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc49a3Q8CE47 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc49a3Q8CE47 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc49a3Q8CE47 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc49a3Q8CE47 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc49a3Q8CE47 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc49a3Q8CE47 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc49a3Q8CE47 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc49a3Q8CE47 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc49a3Q8CE47 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc49a3Q8CE47 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc49a3Q8CE47 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc49a3Q8CE47 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc49a3Q8CE47 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc49a3Q8CE47 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc49a3Q8CE47 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc49a3Q8CE47 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc49a3Q8CE47 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc49a3Q8CE47 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc49a3Q8CE47 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms