Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE24

Pramef8, 4732496O08Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef8Q8CE24 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramef8Q8CE24 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramef8Q8CE24 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramef8Q8CE24 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramef8Q8CE24 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramef8Q8CE24 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramef8Q8CE24 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramef8Q8CE24 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramef8Q8CE24 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramef8Q8CE24 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramef8Q8CE24 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramef8Q8CE24 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramef8Q8CE24 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramef8Q8CE24 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramef8Q8CE24 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramef8Q8CE24 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramef8Q8CE24 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramef8Q8CE24 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramef8Q8CE24 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramef8Q8CE24 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramef8Q8CE24 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramef8Q8CE24 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramef8Q8CE24 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramef8Q8CE24 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramef8Q8CE24 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramef8Q8CE24 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramef8Q8CE24 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramef8Q8CE24 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramef8Q8CE24 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramef8Q8CE24 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramef8Q8CE24 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramef8Q8CE24 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramef8Q8CE24 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramef8Q8CE24 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramef8Q8CE24 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramef8Q8CE24 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramef8Q8CE24 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramef8Q8CE24 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramef8Q8CE24 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pramef8Q8CE24 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pramef8Q8CE24 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pramef8Q8CE24 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pramef8Q8CE24 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pramef8Q8CE24 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pramef8Q8CE24 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pramef8Q8CE24 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pramef8Q8CE24 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pramef8Q8CE24 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pramef8Q8CE24 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pramef8Q8CE24 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pramef8Q8CE24 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pramef8Q8CE24 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pramef8Q8CE24 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pramef8Q8CE24 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pramef8Q8CE24 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pramef8Q8CE24 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pramef8Q8CE24 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pramef8Q8CE24 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pramef8Q8CE24 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pramef8Q8CE24 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pramef8Q8CE24 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pramef8Q8CE24 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pramef8Q8CE24 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pramef8Q8CE24 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramef8Q8CE24 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramef8Q8CE24 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramef8Q8CE24 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramef8Q8CE24 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramef8Q8CE24 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramef8Q8CE24 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramef8Q8CE24 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramef8Q8CE24 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramef8Q8CE24 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramef8Q8CE24 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramef8Q8CE24 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramef8Q8CE24 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramef8Q8CE24 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramef8Q8CE24 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramef8Q8CE24 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramef8Q8CE24 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramef8Q8CE24 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramef8Q8CE24 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramef8Q8CE24 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramef8Q8CE24 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramef8Q8CE24 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramef8Q8CE24 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramef8Q8CE24 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramef8Q8CE24 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramef8Q8CE24 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramef8Q8CE24 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramef8Q8CE24 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramef8Q8CE24 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramef8Q8CE24 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramef8Q8CE24 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramef8Q8CE24 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramef8Q8CE24 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramef8Q8CE24 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramef8Q8CE24 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramef8Q8CE24 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramef8Q8CE24 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.7 ms