Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN8

Ccdc38, Coiled-coil domain-containing protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc38Q8CDN8 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc38Q8CDN8 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc38Q8CDN8 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc38Q8CDN8 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc38Q8CDN8 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc38Q8CDN8 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc38Q8CDN8 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc38Q8CDN8 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc38Q8CDN8 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc38Q8CDN8 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc38Q8CDN8 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc38Q8CDN8 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc38Q8CDN8 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc38Q8CDN8 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc38Q8CDN8 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc38Q8CDN8 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc38Q8CDN8 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc38Q8CDN8 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc38Q8CDN8 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc38Q8CDN8 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc38Q8CDN8 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc38Q8CDN8 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc38Q8CDN8 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc38Q8CDN8 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc38Q8CDN8 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc38Q8CDN8 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc38Q8CDN8 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc38Q8CDN8 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc38Q8CDN8 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc38Q8CDN8 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc38Q8CDN8 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc38Q8CDN8 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc38Q8CDN8 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc38Q8CDN8 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc38Q8CDN8 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc38Q8CDN8 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc38Q8CDN8 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc38Q8CDN8 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc38Q8CDN8 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc38Q8CDN8 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc38Q8CDN8 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc38Q8CDN8 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc38Q8CDN8 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc38Q8CDN8 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc38Q8CDN8 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc38Q8CDN8 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc38Q8CDN8 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc38Q8CDN8 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc38Q8CDN8 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc38Q8CDN8 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc38Q8CDN8 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc38Q8CDN8 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc38Q8CDN8 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc38Q8CDN8 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc38Q8CDN8 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc38Q8CDN8 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc38Q8CDN8 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc38Q8CDN8 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc38Q8CDN8 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc38Q8CDN8 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc38Q8CDN8 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc38Q8CDN8 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc38Q8CDN8 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc38Q8CDN8 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc38Q8CDN8 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc38Q8CDN8 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc38Q8CDN8 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc38Q8CDN8 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc38Q8CDN8 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc38Q8CDN8 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc38Q8CDN8 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc38Q8CDN8 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc38Q8CDN8 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc38Q8CDN8 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc38Q8CDN8 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc38Q8CDN8 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc38Q8CDN8 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc38Q8CDN8 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc38Q8CDN8 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc38Q8CDN8 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc38Q8CDN8 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc38Q8CDN8 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc38Q8CDN8 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc38Q8CDN8 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc38Q8CDN8 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc38Q8CDN8 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc38Q8CDN8 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc38Q8CDN8 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc38Q8CDN8 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc38Q8CDN8 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc38Q8CDN8 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc38Q8CDN8 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc38Q8CDN8 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc38Q8CDN8 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc38Q8CDN8 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc38Q8CDN8 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc38Q8CDN8 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc38Q8CDN8 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc38Q8CDN8 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc38Q8CDN8 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101 ms