Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD94

Lin52, Protein lin-52 homolog, mousemouse

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Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin52Q8CD94 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lin52Q8CD94 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lin52Q8CD94 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lin52Q8CD94 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lin52Q8CD94 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lin52Q8CD94 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Lin52Q8CD94 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lin52Q8CD94 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lin52Q8CD94 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lin52Q8CD94 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lin52Q8CD94 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lin52Q8CD94 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lin52Q8CD94 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lin52Q8CD94 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lin52Q8CD94 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lin52Q8CD94 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lin52Q8CD94 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lin52Q8CD94 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lin52Q8CD94 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lin52Q8CD94 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lin52Q8CD94 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lin52Q8CD94 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lin52Q8CD94 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Lin52Q8CD94 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lin52Q8CD94 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lin52Q8CD94 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Lin52Q8CD94 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lin52Q8CD94 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lin52Q8CD94 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lin52Q8CD94 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lin52Q8CD94 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lin52Q8CD94 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lin52Q8CD94 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lin52Q8CD94 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lin52Q8CD94 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lin52Q8CD94 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Lin52Q8CD94 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lin52Q8CD94 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lin52Q8CD94 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lin52Q8CD94 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lin52Q8CD94 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lin52Q8CD94 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lin52Q8CD94 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lin52Q8CD94 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lin52Q8CD94 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lin52Q8CD94 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lin52Q8CD94 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lin52Q8CD94 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lin52Q8CD94 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lin52Q8CD94 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lin52Q8CD94 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lin52Q8CD94 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lin52Q8CD94 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lin52Q8CD94 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lin52Q8CD94 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lin52Q8CD94 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lin52Q8CD94 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lin52Q8CD94 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lin52Q8CD94 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lin52Q8CD94 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lin52Q8CD94 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lin52Q8CD94 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lin52Q8CD94 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lin52Q8CD94 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lin52Q8CD94 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lin52Q8CD94 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lin52Q8CD94 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lin52Q8CD94 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Lin52Q8CD94 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lin52Q8CD94 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lin52Q8CD94 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lin52Q8CD94 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lin52Q8CD94 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lin52Q8CD94 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lin52Q8CD94 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lin52Q8CD94 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lin52Q8CD94 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lin52Q8CD94 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lin52Q8CD94 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lin52Q8CD94 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lin52Q8CD94 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lin52Q8CD94 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lin52Q8CD94 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lin52Q8CD94 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lin52Q8CD94 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lin52Q8CD94 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lin52Q8CD94 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Lin52Q8CD94 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Lin52Q8CD94 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Lin52Q8CD94 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Lin52Q8CD94 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Lin52Q8CD94 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lin52Q8CD94 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lin52Q8CD94 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lin52Q8CD94 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lin52Q8CD94 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lin52Q8CD94 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Lin52Q8CD94 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lin52Q8CD94 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lin52Q8CD94 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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