Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCI5

Rybp, RING1 and YY1-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RybpQ8CCI5 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RybpQ8CCI5 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RybpQ8CCI5 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RybpQ8CCI5 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RybpQ8CCI5 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RybpQ8CCI5 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RybpQ8CCI5 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RybpQ8CCI5 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RybpQ8CCI5 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RybpQ8CCI5 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RybpQ8CCI5 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RybpQ8CCI5 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RybpQ8CCI5 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RybpQ8CCI5 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RybpQ8CCI5 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RybpQ8CCI5 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RybpQ8CCI5 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RybpQ8CCI5 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RybpQ8CCI5 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RybpQ8CCI5 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RybpQ8CCI5 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RybpQ8CCI5 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RybpQ8CCI5 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RybpQ8CCI5 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RybpQ8CCI5 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RybpQ8CCI5 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RybpQ8CCI5 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RybpQ8CCI5 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RybpQ8CCI5 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RybpQ8CCI5 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RybpQ8CCI5 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RybpQ8CCI5 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RybpQ8CCI5 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RybpQ8CCI5 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RybpQ8CCI5 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RybpQ8CCI5 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RybpQ8CCI5 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RybpQ8CCI5 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RybpQ8CCI5 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RybpQ8CCI5 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RybpQ8CCI5 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RybpQ8CCI5 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RybpQ8CCI5 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RybpQ8CCI5 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RybpQ8CCI5 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RybpQ8CCI5 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms