Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Nhlrc3Q8CCH2 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Nhlrc3Q8CCH2 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Nhlrc3Q8CCH2 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Nhlrc3Q8CCH2 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Nhlrc3Q8CCH2 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Nhlrc3Q8CCH2 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Nhlrc3Q8CCH2 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Nhlrc3Q8CCH2 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Nhlrc3Q8CCH2 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Nhlrc3Q8CCH2 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Nhlrc3Q8CCH2 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Nhlrc3Q8CCH2 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Nhlrc3Q8CCH2 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Nhlrc3Q8CCH2 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Nhlrc3Q8CCH2 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Nhlrc3Q8CCH2 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Nhlrc3Q8CCH2 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Nhlrc3Q8CCH2 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Nhlrc3Q8CCH2 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Nhlrc3Q8CCH2 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Nhlrc3Q8CCH2 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Nhlrc3Q8CCH2 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Nhlrc3Q8CCH2 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Nhlrc3Q8CCH2 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Nhlrc3Q8CCH2 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Nhlrc3Q8CCH2 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Nhlrc3Q8CCH2 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Nhlrc3Q8CCH2 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Nhlrc3Q8CCH2 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Nhlrc3Q8CCH2 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Nhlrc3Q8CCH2 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Nhlrc3Q8CCH2 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Nhlrc3Q8CCH2 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Nhlrc3Q8CCH2 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Nhlrc3Q8CCH2 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Nhlrc3Q8CCH2 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Nhlrc3Q8CCH2 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Nhlrc3Q8CCH2 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Nhlrc3Q8CCH2 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Nhlrc3Q8CCH2 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Nhlrc3Q8CCH2 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Nhlrc3Q8CCH2 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Nhlrc3Q8CCH2 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Nhlrc3Q8CCH2 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Nhlrc3Q8CCH2 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Nhlrc3Q8CCH2 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Nhlrc3Q8CCH2 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Nhlrc3Q8CCH2 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Nhlrc3Q8CCH2 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Nhlrc3Q8CCH2 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Nhlrc3Q8CCH2 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Nhlrc3Q8CCH2 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Nhlrc3Q8CCH2 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Nhlrc3Q8CCH2 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Nhlrc3Q8CCH2 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Nhlrc3Q8CCH2 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Nhlrc3Q8CCH2 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Nhlrc3Q8CCH2 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Nhlrc3Q8CCH2 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Nhlrc3Q8CCH2 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Nhlrc3Q8CCH2 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
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