Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBD1

Nrip1, Nuclear receptor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrip1Q8CBD1 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nrip1Q8CBD1 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nrip1Q8CBD1 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nrip1Q8CBD1 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Nrip1Q8CBD1 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nrip1Q8CBD1 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Nrip1Q8CBD1 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nrip1Q8CBD1 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nrip1Q8CBD1 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nrip1Q8CBD1 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nrip1Q8CBD1 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nrip1Q8CBD1 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nrip1Q8CBD1 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nrip1Q8CBD1 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nrip1Q8CBD1 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nrip1Q8CBD1 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nrip1Q8CBD1 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nrip1Q8CBD1 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nrip1Q8CBD1 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nrip1Q8CBD1 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nrip1Q8CBD1 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nrip1Q8CBD1 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Nrip1Q8CBD1 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nrip1Q8CBD1 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nrip1Q8CBD1 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nrip1Q8CBD1 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nrip1Q8CBD1 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nrip1Q8CBD1 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nrip1Q8CBD1 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nrip1Q8CBD1 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nrip1Q8CBD1 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nrip1Q8CBD1 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nrip1Q8CBD1 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nrip1Q8CBD1 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nrip1Q8CBD1 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nrip1Q8CBD1 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nrip1Q8CBD1 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nrip1Q8CBD1 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nrip1Q8CBD1 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nrip1Q8CBD1 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nrip1Q8CBD1 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nrip1Q8CBD1 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nrip1Q8CBD1 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nrip1Q8CBD1 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nrip1Q8CBD1 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nrip1Q8CBD1 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nrip1Q8CBD1 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nrip1Q8CBD1 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Nrip1Q8CBD1 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nrip1Q8CBD1 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nrip1Q8CBD1 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nrip1Q8CBD1 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nrip1Q8CBD1 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nrip1Q8CBD1 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nrip1Q8CBD1 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Nrip1Q8CBD1 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nrip1Q8CBD1 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nrip1Q8CBD1 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nrip1Q8CBD1 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nrip1Q8CBD1 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nrip1Q8CBD1 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nrip1Q8CBD1 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nrip1Q8CBD1 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nrip1Q8CBD1 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nrip1Q8CBD1 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nrip1Q8CBD1 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nrip1Q8CBD1 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nrip1Q8CBD1 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nrip1Q8CBD1 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nrip1Q8CBD1 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nrip1Q8CBD1 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nrip1Q8CBD1 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nrip1Q8CBD1 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nrip1Q8CBD1 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nrip1Q8CBD1 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nrip1Q8CBD1 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nrip1Q8CBD1 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nrip1Q8CBD1 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nrip1Q8CBD1 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nrip1Q8CBD1 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Nrip1Q8CBD1 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Nrip1Q8CBD1 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Nrip1Q8CBD1 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Nrip1Q8CBD1 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Nrip1Q8CBD1 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Nrip1Q8CBD1 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Nrip1Q8CBD1 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nrip1Q8CBD1 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nrip1Q8CBD1 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nrip1Q8CBD1 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nrip1Q8CBD1 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nrip1Q8CBD1 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nrip1Q8CBD1 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nrip1Q8CBD1 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nrip1Q8CBD1 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nrip1Q8CBD1 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nrip1Q8CBD1 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nrip1Q8CBD1 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nrip1Q8CBD1 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nrip1Q8CBD1 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms