Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8K6

Atxn7l2, Ataxin 7-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn7l2Q8C8K6 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atxn7l2Q8C8K6 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Atxn7l2Q8C8K6 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atxn7l2Q8C8K6 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atxn7l2Q8C8K6 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atxn7l2Q8C8K6 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atxn7l2Q8C8K6 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atxn7l2Q8C8K6 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atxn7l2Q8C8K6 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atxn7l2Q8C8K6 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atxn7l2Q8C8K6 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atxn7l2Q8C8K6 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atxn7l2Q8C8K6 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atxn7l2Q8C8K6 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Atxn7l2Q8C8K6 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atxn7l2Q8C8K6 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atxn7l2Q8C8K6 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atxn7l2Q8C8K6 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Atxn7l2Q8C8K6 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Atxn7l2Q8C8K6 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atxn7l2Q8C8K6 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atxn7l2Q8C8K6 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atxn7l2Q8C8K6 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atxn7l2Q8C8K6 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atxn7l2Q8C8K6 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atxn7l2Q8C8K6 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Atxn7l2Q8C8K6 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Atxn7l2Q8C8K6 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atxn7l2Q8C8K6 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atxn7l2Q8C8K6 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atxn7l2Q8C8K6 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Atxn7l2Q8C8K6 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atxn7l2Q8C8K6 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Atxn7l2Q8C8K6 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Atxn7l2Q8C8K6 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atxn7l2Q8C8K6 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atxn7l2Q8C8K6 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atxn7l2Q8C8K6 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atxn7l2Q8C8K6 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atxn7l2Q8C8K6 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atxn7l2Q8C8K6 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atxn7l2Q8C8K6 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atxn7l2Q8C8K6 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Atxn7l2Q8C8K6 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atxn7l2Q8C8K6 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atxn7l2Q8C8K6 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Atxn7l2Q8C8K6 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Atxn7l2Q8C8K6 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atxn7l2Q8C8K6 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atxn7l2Q8C8K6 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atxn7l2Q8C8K6 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atxn7l2Q8C8K6 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atxn7l2Q8C8K6 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atxn7l2Q8C8K6 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atxn7l2Q8C8K6 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atxn7l2Q8C8K6 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atxn7l2Q8C8K6 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atxn7l2Q8C8K6 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atxn7l2Q8C8K6 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atxn7l2Q8C8K6 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atxn7l2Q8C8K6 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atxn7l2Q8C8K6 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atxn7l2Q8C8K6 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atxn7l2Q8C8K6 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atxn7l2Q8C8K6 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Atxn7l2Q8C8K6 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Atxn7l2Q8C8K6 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atxn7l2Q8C8K6 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atxn7l2Q8C8K6 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atxn7l2Q8C8K6 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atxn7l2Q8C8K6 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Atxn7l2Q8C8K6 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atxn7l2Q8C8K6 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atxn7l2Q8C8K6 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atxn7l2Q8C8K6 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atxn7l2Q8C8K6 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atxn7l2Q8C8K6 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atxn7l2Q8C8K6 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atxn7l2Q8C8K6 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atxn7l2Q8C8K6 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atxn7l2Q8C8K6 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atxn7l2Q8C8K6 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atxn7l2Q8C8K6 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atxn7l2Q8C8K6 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atxn7l2Q8C8K6 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atxn7l2Q8C8K6 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atxn7l2Q8C8K6 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atxn7l2Q8C8K6 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atxn7l2Q8C8K6 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atxn7l2Q8C8K6 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atxn7l2Q8C8K6 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Atxn7l2Q8C8K6 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atxn7l2Q8C8K6 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atxn7l2Q8C8K6 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atxn7l2Q8C8K6 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atxn7l2Q8C8K6 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atxn7l2Q8C8K6 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atxn7l2Q8C8K6 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atxn7l2Q8C8K6 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atxn7l2Q8C8K6 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms