Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7E7

Stbd1, Starch-binding domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stbd1Q8C7E7 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stbd1Q8C7E7 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stbd1Q8C7E7 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stbd1Q8C7E7 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stbd1Q8C7E7 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Stbd1Q8C7E7 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stbd1Q8C7E7 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stbd1Q8C7E7 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stbd1Q8C7E7 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stbd1Q8C7E7 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stbd1Q8C7E7 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stbd1Q8C7E7 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stbd1Q8C7E7 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Stbd1Q8C7E7 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Stbd1Q8C7E7 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Stbd1Q8C7E7 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stbd1Q8C7E7 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stbd1Q8C7E7 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stbd1Q8C7E7 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stbd1Q8C7E7 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stbd1Q8C7E7 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stbd1Q8C7E7 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stbd1Q8C7E7 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stbd1Q8C7E7 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stbd1Q8C7E7 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stbd1Q8C7E7 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stbd1Q8C7E7 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stbd1Q8C7E7 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stbd1Q8C7E7 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stbd1Q8C7E7 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stbd1Q8C7E7 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stbd1Q8C7E7 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stbd1Q8C7E7 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Stbd1Q8C7E7 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Stbd1Q8C7E7 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Stbd1Q8C7E7 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stbd1Q8C7E7 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Stbd1Q8C7E7 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stbd1Q8C7E7 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Stbd1Q8C7E7 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stbd1Q8C7E7 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Stbd1Q8C7E7 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stbd1Q8C7E7 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stbd1Q8C7E7 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stbd1Q8C7E7 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Stbd1Q8C7E7 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stbd1Q8C7E7 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stbd1Q8C7E7 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stbd1Q8C7E7 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stbd1Q8C7E7 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stbd1Q8C7E7 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stbd1Q8C7E7 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Stbd1Q8C7E7 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stbd1Q8C7E7 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stbd1Q8C7E7 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stbd1Q8C7E7 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stbd1Q8C7E7 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stbd1Q8C7E7 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stbd1Q8C7E7 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stbd1Q8C7E7 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms