Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

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Length 916 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp20Q8C6M1 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp20Q8C6M1 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp20Q8C6M1 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp20Q8C6M1 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp20Q8C6M1 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp20Q8C6M1 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp20Q8C6M1 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp20Q8C6M1 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp20Q8C6M1 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp20Q8C6M1 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp20Q8C6M1 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp20Q8C6M1 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp20Q8C6M1 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp20Q8C6M1 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp20Q8C6M1 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp20Q8C6M1 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp20Q8C6M1 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp20Q8C6M1 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp20Q8C6M1 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp20Q8C6M1 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp20Q8C6M1 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp20Q8C6M1 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp20Q8C6M1 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp20Q8C6M1 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp20Q8C6M1 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp20Q8C6M1 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp20Q8C6M1 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp20Q8C6M1 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp20Q8C6M1 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp20Q8C6M1 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp20Q8C6M1 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp20Q8C6M1 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp20Q8C6M1 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp20Q8C6M1 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp20Q8C6M1 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp20Q8C6M1 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp20Q8C6M1 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp20Q8C6M1 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp20Q8C6M1 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp20Q8C6M1 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp20Q8C6M1 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp20Q8C6M1 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp20Q8C6M1 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp20Q8C6M1 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp20Q8C6M1 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp20Q8C6M1 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp20Q8C6M1 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp20Q8C6M1 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp20Q8C6M1 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp20Q8C6M1 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp20Q8C6M1 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp20Q8C6M1 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp20Q8C6M1 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp20Q8C6M1 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp20Q8C6M1 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp20Q8C6M1 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp20Q8C6M1 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp20Q8C6M1 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp20Q8C6M1 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp20Q8C6M1 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp20Q8C6M1 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp20Q8C6M1 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp20Q8C6M1 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp20Q8C6M1 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp20Q8C6M1 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp20Q8C6M1 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp20Q8C6M1 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp20Q8C6M1 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp20Q8C6M1 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp20Q8C6M1 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp20Q8C6M1 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp20Q8C6M1 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp20Q8C6M1 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp20Q8C6M1 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp20Q8C6M1 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp20Q8C6M1 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp20Q8C6M1 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp20Q8C6M1 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp20Q8C6M1 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp20Q8C6M1 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp20Q8C6M1 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp20Q8C6M1 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp20Q8C6M1 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp20Q8C6M1 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp20Q8C6M1 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp20Q8C6M1 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp20Q8C6M1 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp20Q8C6M1 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp20Q8C6M1 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp20Q8C6M1 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp20Q8C6M1 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp20Q8C6M1 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp20Q8C6M1 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp20Q8C6M1 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp20Q8C6M1 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp20Q8C6M1 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp20Q8C6M1 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp20Q8C6M1 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp20Q8C6M1 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
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