Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6A8

Bhlhe22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe22Q8C6A8 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bhlhe22Q8C6A8 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Bhlhe22Q8C6A8 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Bhlhe22Q8C6A8 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Bhlhe22Q8C6A8 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Bhlhe22Q8C6A8 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Bhlhe22Q8C6A8 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Bhlhe22Q8C6A8 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Bhlhe22Q8C6A8 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bhlhe22Q8C6A8 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bhlhe22Q8C6A8 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bhlhe22Q8C6A8 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bhlhe22Q8C6A8 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bhlhe22Q8C6A8 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bhlhe22Q8C6A8 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bhlhe22Q8C6A8 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bhlhe22Q8C6A8 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bhlhe22Q8C6A8 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bhlhe22Q8C6A8 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bhlhe22Q8C6A8 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bhlhe22Q8C6A8 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bhlhe22Q8C6A8 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bhlhe22Q8C6A8 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bhlhe22Q8C6A8 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bhlhe22Q8C6A8 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bhlhe22Q8C6A8 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms