Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5C9

TPA-induced transmembrane protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C5C9 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q8C5C9 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q8C5C9 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q8C5C9 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q8C5C9 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q8C5C9 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q8C5C9 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q8C5C9 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q8C5C9 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q8C5C9 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q8C5C9 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q8C5C9 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q8C5C9 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q8C5C9 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q8C5C9 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q8C5C9 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q8C5C9 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q8C5C9 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q8C5C9 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q8C5C9 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q8C5C9 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q8C5C9 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q8C5C9 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q8C5C9 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q8C5C9 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q8C5C9 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q8C5C9 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q8C5C9 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q8C5C9 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q8C5C9 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q8C5C9 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q8C5C9 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q8C5C9 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q8C5C9 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q8C5C9 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q8C5C9 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q8C5C9 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q8C5C9 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q8C5C9 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q8C5C9 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q8C5C9 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q8C5C9 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q8C5C9 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q8C5C9 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q8C5C9 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q8C5C9 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q8C5C9 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q8C5C9 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q8C5C9 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Q8C5C9 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Q8C5C9 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q8C5C9 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q8C5C9 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q8C5C9 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q8C5C9 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q8C5C9 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q8C5C9 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q8C5C9 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q8C5C9 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q8C5C9 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q8C5C9 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q8C5C9 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q8C5C9 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q8C5C9 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q8C5C9 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Q8C5C9 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q8C5C9 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Q8C5C9 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q8C5C9 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q8C5C9 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q8C5C9 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q8C5C9 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q8C5C9 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q8C5C9 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q8C5C9 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q8C5C9 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q8C5C9 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q8C5C9 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q8C5C9 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q8C5C9 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q8C5C9 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Q8C5C9 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q8C5C9 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q8C5C9 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q8C5C9 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q8C5C9 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q8C5C9 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q8C5C9 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q8C5C9 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q8C5C9 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q8C5C9 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q8C5C9 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q8C5C9 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q8C5C9 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q8C5C9 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q8C5C9 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q8C5C9 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q8C5C9 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q8C5C9 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q8C5C9 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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