Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXT9

Sec22c, Vesicle-trafficking protein SEC22c, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22cQ8BXT9 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec22cQ8BXT9 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec22cQ8BXT9 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec22cQ8BXT9 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec22cQ8BXT9 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec22cQ8BXT9 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec22cQ8BXT9 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec22cQ8BXT9 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec22cQ8BXT9 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec22cQ8BXT9 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec22cQ8BXT9 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec22cQ8BXT9 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec22cQ8BXT9 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec22cQ8BXT9 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec22cQ8BXT9 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec22cQ8BXT9 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec22cQ8BXT9 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec22cQ8BXT9 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec22cQ8BXT9 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec22cQ8BXT9 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec22cQ8BXT9 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec22cQ8BXT9 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec22cQ8BXT9 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec22cQ8BXT9 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec22cQ8BXT9 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec22cQ8BXT9 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec22cQ8BXT9 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec22cQ8BXT9 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec22cQ8BXT9 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec22cQ8BXT9 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec22cQ8BXT9 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec22cQ8BXT9 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec22cQ8BXT9 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec22cQ8BXT9 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec22cQ8BXT9 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec22cQ8BXT9 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec22cQ8BXT9 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec22cQ8BXT9 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec22cQ8BXT9 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec22cQ8BXT9 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec22cQ8BXT9 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec22cQ8BXT9 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec22cQ8BXT9 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec22cQ8BXT9 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec22cQ8BXT9 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sec22cQ8BXT9 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec22cQ8BXT9 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec22cQ8BXT9 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec22cQ8BXT9 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec22cQ8BXT9 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec22cQ8BXT9 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec22cQ8BXT9 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec22cQ8BXT9 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec22cQ8BXT9 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec22cQ8BXT9 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec22cQ8BXT9 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec22cQ8BXT9 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec22cQ8BXT9 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec22cQ8BXT9 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec22cQ8BXT9 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec22cQ8BXT9 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec22cQ8BXT9 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec22cQ8BXT9 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec22cQ8BXT9 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec22cQ8BXT9 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec22cQ8BXT9 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec22cQ8BXT9 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec22cQ8BXT9 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec22cQ8BXT9 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec22cQ8BXT9 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec22cQ8BXT9 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec22cQ8BXT9 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec22cQ8BXT9 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec22cQ8BXT9 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec22cQ8BXT9 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec22cQ8BXT9 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec22cQ8BXT9 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec22cQ8BXT9 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec22cQ8BXT9 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec22cQ8BXT9 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec22cQ8BXT9 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec22cQ8BXT9 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec22cQ8BXT9 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sec22cQ8BXT9 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec22cQ8BXT9 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec22cQ8BXT9 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec22cQ8BXT9 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec22cQ8BXT9 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec22cQ8BXT9 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec22cQ8BXT9 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec22cQ8BXT9 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec22cQ8BXT9 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec22cQ8BXT9 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec22cQ8BXT9 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec22cQ8BXT9 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec22cQ8BXT9 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec22cQ8BXT9 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec22cQ8BXT9 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec22cQ8BXT9 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sec22cQ8BXT9 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms