Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube3dQ8BX13 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube3dQ8BX13 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube3dQ8BX13 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube3dQ8BX13 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube3dQ8BX13 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube3dQ8BX13 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube3dQ8BX13 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube3dQ8BX13 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube3dQ8BX13 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube3dQ8BX13 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube3dQ8BX13 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube3dQ8BX13 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube3dQ8BX13 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube3dQ8BX13 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube3dQ8BX13 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube3dQ8BX13 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube3dQ8BX13 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube3dQ8BX13 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube3dQ8BX13 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube3dQ8BX13 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube3dQ8BX13 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube3dQ8BX13 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube3dQ8BX13 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube3dQ8BX13 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube3dQ8BX13 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube3dQ8BX13 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube3dQ8BX13 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube3dQ8BX13 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube3dQ8BX13 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube3dQ8BX13 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube3dQ8BX13 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube3dQ8BX13 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube3dQ8BX13 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube3dQ8BX13 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube3dQ8BX13 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube3dQ8BX13 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube3dQ8BX13 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube3dQ8BX13 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube3dQ8BX13 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube3dQ8BX13 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube3dQ8BX13 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube3dQ8BX13 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube3dQ8BX13 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube3dQ8BX13 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube3dQ8BX13 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube3dQ8BX13 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube3dQ8BX13 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube3dQ8BX13 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube3dQ8BX13 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube3dQ8BX13 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube3dQ8BX13 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube3dQ8BX13 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube3dQ8BX13 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube3dQ8BX13 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube3dQ8BX13 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube3dQ8BX13 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube3dQ8BX13 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube3dQ8BX13 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube3dQ8BX13 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube3dQ8BX13 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube3dQ8BX13 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube3dQ8BX13 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube3dQ8BX13 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube3dQ8BX13 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ube3dQ8BX13 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ube3dQ8BX13 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ube3dQ8BX13 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ube3dQ8BX13 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ube3dQ8BX13 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ube3dQ8BX13 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ube3dQ8BX13 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ube3dQ8BX13 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ube3dQ8BX13 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ube3dQ8BX13 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ube3dQ8BX13 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ube3dQ8BX13 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ube3dQ8BX13 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ube3dQ8BX13 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ube3dQ8BX13 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ube3dQ8BX13 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ube3dQ8BX13 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ube3dQ8BX13 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ube3dQ8BX13 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ube3dQ8BX13 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ube3dQ8BX13 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ube3dQ8BX13 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ube3dQ8BX13 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ube3dQ8BX13 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ube3dQ8BX13 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ube3dQ8BX13 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ube3dQ8BX13 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ube3dQ8BX13 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ube3dQ8BX13 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ube3dQ8BX13 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ube3dQ8BX13 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ube3dQ8BX13 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ube3dQ8BX13 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ube3dQ8BX13 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ube3dQ8BX13 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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