Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx17Q8BVL3 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx17Q8BVL3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx17Q8BVL3 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx17Q8BVL3 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx17Q8BVL3 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx17Q8BVL3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx17Q8BVL3 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx17Q8BVL3 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx17Q8BVL3 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx17Q8BVL3 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx17Q8BVL3 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx17Q8BVL3 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx17Q8BVL3 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx17Q8BVL3 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx17Q8BVL3 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx17Q8BVL3 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx17Q8BVL3 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx17Q8BVL3 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx17Q8BVL3 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx17Q8BVL3 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx17Q8BVL3 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx17Q8BVL3 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx17Q8BVL3 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx17Q8BVL3 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx17Q8BVL3 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx17Q8BVL3 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx17Q8BVL3 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx17Q8BVL3 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx17Q8BVL3 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx17Q8BVL3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx17Q8BVL3 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snx17Q8BVL3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snx17Q8BVL3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snx17Q8BVL3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snx17Q8BVL3 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snx17Q8BVL3 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Snx17Q8BVL3 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snx17Q8BVL3 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snx17Q8BVL3 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snx17Q8BVL3 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Snx17Q8BVL3 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snx17Q8BVL3 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snx17Q8BVL3 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snx17Q8BVL3 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Snx17Q8BVL3 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Snx17Q8BVL3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx17Q8BVL3 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx17Q8BVL3 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx17Q8BVL3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx17Q8BVL3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx17Q8BVL3 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx17Q8BVL3 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx17Q8BVL3 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx17Q8BVL3 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx17Q8BVL3 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx17Q8BVL3 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx17Q8BVL3 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx17Q8BVL3 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx17Q8BVL3 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx17Q8BVL3 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx17Q8BVL3 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx17Q8BVL3 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx17Q8BVL3 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx17Q8BVL3 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx17Q8BVL3 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx17Q8BVL3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx17Q8BVL3 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx17Q8BVL3 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx17Q8BVL3 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx17Q8BVL3 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx17Q8BVL3 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx17Q8BVL3 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx17Q8BVL3 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx17Q8BVL3 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx17Q8BVL3 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx17Q8BVL3 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx17Q8BVL3 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx17Q8BVL3 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx17Q8BVL3 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx17Q8BVL3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx17Q8BVL3 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx17Q8BVL3 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx17Q8BVL3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx17Q8BVL3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx17Q8BVL3 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx17Q8BVL3 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx17Q8BVL3 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx17Q8BVL3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx17Q8BVL3 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx17Q8BVL3 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx17Q8BVL3 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx17Q8BVL3 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx17Q8BVL3 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx17Q8BVL3 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx17Q8BVL3 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx17Q8BVL3 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx17Q8BVL3 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx17Q8BVL3 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx17Q8BVL3 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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