Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSQ9

Pbrm1, Protein polybromo-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbrm1Q8BSQ9 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Pbrm1Q8BSQ9 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pbrm1Q8BSQ9 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pbrm1Q8BSQ9 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pbrm1Q8BSQ9 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pbrm1Q8BSQ9 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pbrm1Q8BSQ9 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Pbrm1Q8BSQ9 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pbrm1Q8BSQ9 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pbrm1Q8BSQ9 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pbrm1Q8BSQ9 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pbrm1Q8BSQ9 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pbrm1Q8BSQ9 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pbrm1Q8BSQ9 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Pbrm1Q8BSQ9 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pbrm1Q8BSQ9 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pbrm1Q8BSQ9 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pbrm1Q8BSQ9 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pbrm1Q8BSQ9 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pbrm1Q8BSQ9 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pbrm1Q8BSQ9 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pbrm1Q8BSQ9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pbrm1Q8BSQ9 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pbrm1Q8BSQ9 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pbrm1Q8BSQ9 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pbrm1Q8BSQ9 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pbrm1Q8BSQ9 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pbrm1Q8BSQ9 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Pbrm1Q8BSQ9 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Pbrm1Q8BSQ9 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Pbrm1Q8BSQ9 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pbrm1Q8BSQ9 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pbrm1Q8BSQ9 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pbrm1Q8BSQ9 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pbrm1Q8BSQ9 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pbrm1Q8BSQ9 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pbrm1Q8BSQ9 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pbrm1Q8BSQ9 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pbrm1Q8BSQ9 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pbrm1Q8BSQ9 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pbrm1Q8BSQ9 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pbrm1Q8BSQ9 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Pbrm1Q8BSQ9 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Pbrm1Q8BSQ9 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.76
Pbrm1Q8BSQ9 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Pbrm1Q8BSQ9 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Pbrm1Q8BSQ9 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Pbrm1Q8BSQ9 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Pbrm1Q8BSQ9 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Pbrm1Q8BSQ9 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Pbrm1Q8BSQ9 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Pbrm1Q8BSQ9 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Pbrm1Q8BSQ9 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Pbrm1Q8BSQ9 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Pbrm1Q8BSQ9 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pbrm1Q8BSQ9 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pbrm1Q8BSQ9 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pbrm1Q8BSQ9 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pbrm1Q8BSQ9 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pbrm1Q8BSQ9 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pbrm1Q8BSQ9 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pbrm1Q8BSQ9 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pbrm1Q8BSQ9 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pbrm1Q8BSQ9 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Pbrm1Q8BSQ9 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pbrm1Q8BSQ9 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pbrm1Q8BSQ9 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pbrm1Q8BSQ9 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pbrm1Q8BSQ9 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pbrm1Q8BSQ9 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pbrm1Q8BSQ9 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pbrm1Q8BSQ9 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pbrm1Q8BSQ9 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pbrm1Q8BSQ9 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pbrm1Q8BSQ9 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pbrm1Q8BSQ9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pbrm1Q8BSQ9 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pbrm1Q8BSQ9 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pbrm1Q8BSQ9 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pbrm1Q8BSQ9 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pbrm1Q8BSQ9 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pbrm1Q8BSQ9 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pbrm1Q8BSQ9 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pbrm1Q8BSQ9 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pbrm1Q8BSQ9 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pbrm1Q8BSQ9 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pbrm1Q8BSQ9 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pbrm1Q8BSQ9 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pbrm1Q8BSQ9 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pbrm1Q8BSQ9 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pbrm1Q8BSQ9 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pbrm1Q8BSQ9 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pbrm1Q8BSQ9 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pbrm1Q8BSQ9 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pbrm1Q8BSQ9 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pbrm1Q8BSQ9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pbrm1Q8BSQ9 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pbrm1Q8BSQ9 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pbrm1Q8BSQ9 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pbrm1Q8BSQ9 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms