Protein–RNA interactions for Protein: Q8BPB5

Efemp1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efemp1Q8BPB5 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Efemp1Q8BPB5 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Efemp1Q8BPB5 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Efemp1Q8BPB5 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Efemp1Q8BPB5 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Efemp1Q8BPB5 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Efemp1Q8BPB5 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Efemp1Q8BPB5 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Efemp1Q8BPB5 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Efemp1Q8BPB5 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Efemp1Q8BPB5 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efemp1Q8BPB5 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efemp1Q8BPB5 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efemp1Q8BPB5 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efemp1Q8BPB5 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efemp1Q8BPB5 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efemp1Q8BPB5 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efemp1Q8BPB5 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Efemp1Q8BPB5 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efemp1Q8BPB5 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Efemp1Q8BPB5 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efemp1Q8BPB5 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efemp1Q8BPB5 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Efemp1Q8BPB5 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efemp1Q8BPB5 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efemp1Q8BPB5 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efemp1Q8BPB5 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efemp1Q8BPB5 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efemp1Q8BPB5 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efemp1Q8BPB5 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efemp1Q8BPB5 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efemp1Q8BPB5 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efemp1Q8BPB5 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efemp1Q8BPB5 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efemp1Q8BPB5 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efemp1Q8BPB5 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efemp1Q8BPB5 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efemp1Q8BPB5 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efemp1Q8BPB5 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efemp1Q8BPB5 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Efemp1Q8BPB5 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Efemp1Q8BPB5 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Efemp1Q8BPB5 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Efemp1Q8BPB5 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Efemp1Q8BPB5 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Efemp1Q8BPB5 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Efemp1Q8BPB5 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Efemp1Q8BPB5 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Efemp1Q8BPB5 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Efemp1Q8BPB5 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Efemp1Q8BPB5 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Efemp1Q8BPB5 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Efemp1Q8BPB5 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Efemp1Q8BPB5 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Efemp1Q8BPB5 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Efemp1Q8BPB5 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Efemp1Q8BPB5 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Efemp1Q8BPB5 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Efemp1Q8BPB5 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Efemp1Q8BPB5 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efemp1Q8BPB5 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efemp1Q8BPB5 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efemp1Q8BPB5 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efemp1Q8BPB5 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efemp1Q8BPB5 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efemp1Q8BPB5 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efemp1Q8BPB5 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efemp1Q8BPB5 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efemp1Q8BPB5 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efemp1Q8BPB5 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efemp1Q8BPB5 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efemp1Q8BPB5 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efemp1Q8BPB5 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efemp1Q8BPB5 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efemp1Q8BPB5 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efemp1Q8BPB5 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efemp1Q8BPB5 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efemp1Q8BPB5 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efemp1Q8BPB5 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efemp1Q8BPB5 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efemp1Q8BPB5 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efemp1Q8BPB5 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efemp1Q8BPB5 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efemp1Q8BPB5 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efemp1Q8BPB5 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efemp1Q8BPB5 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efemp1Q8BPB5 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efemp1Q8BPB5 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efemp1Q8BPB5 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efemp1Q8BPB5 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efemp1Q8BPB5 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efemp1Q8BPB5 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efemp1Q8BPB5 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Efemp1Q8BPB5 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efemp1Q8BPB5 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efemp1Q8BPB5 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efemp1Q8BPB5 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efemp1Q8BPB5 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Efemp1Q8BPB5 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Efemp1Q8BPB5 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms