Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMF5

Grik4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik4Q8BMF5 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Grik4Q8BMF5 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Grik4Q8BMF5 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Grik4Q8BMF5 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Grik4Q8BMF5 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Grik4Q8BMF5 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Grik4Q8BMF5 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Grik4Q8BMF5 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Grik4Q8BMF5 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Grik4Q8BMF5 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Grik4Q8BMF5 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Grik4Q8BMF5 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Grik4Q8BMF5 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Grik4Q8BMF5 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Grik4Q8BMF5 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Grik4Q8BMF5 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Grik4Q8BMF5 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Grik4Q8BMF5 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Grik4Q8BMF5 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Grik4Q8BMF5 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Grik4Q8BMF5 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Grik4Q8BMF5 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Grik4Q8BMF5 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Grik4Q8BMF5 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Grik4Q8BMF5 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Grik4Q8BMF5 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Grik4Q8BMF5 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Grik4Q8BMF5 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Grik4Q8BMF5 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Grik4Q8BMF5 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Grik4Q8BMF5 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Grik4Q8BMF5 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Grik4Q8BMF5 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Grik4Q8BMF5 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Grik4Q8BMF5 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Grik4Q8BMF5 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Grik4Q8BMF5 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Grik4Q8BMF5 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Grik4Q8BMF5 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Grik4Q8BMF5 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Grik4Q8BMF5 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Grik4Q8BMF5 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Grik4Q8BMF5 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Grik4Q8BMF5 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Grik4Q8BMF5 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Grik4Q8BMF5 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Grik4Q8BMF5 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Grik4Q8BMF5 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Grik4Q8BMF5 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Grik4Q8BMF5 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Grik4Q8BMF5 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Grik4Q8BMF5 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Grik4Q8BMF5 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Grik4Q8BMF5 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Grik4Q8BMF5 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Grik4Q8BMF5 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Grik4Q8BMF5 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Grik4Q8BMF5 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Grik4Q8BMF5 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Grik4Q8BMF5 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Grik4Q8BMF5 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Grik4Q8BMF5 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Grik4Q8BMF5 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Grik4Q8BMF5 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Grik4Q8BMF5 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Grik4Q8BMF5 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Grik4Q8BMF5 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Grik4Q8BMF5 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Grik4Q8BMF5 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Grik4Q8BMF5 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Grik4Q8BMF5 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Grik4Q8BMF5 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Grik4Q8BMF5 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Grik4Q8BMF5 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Grik4Q8BMF5 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Grik4Q8BMF5 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Grik4Q8BMF5 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Grik4Q8BMF5 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Grik4Q8BMF5 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Grik4Q8BMF5 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Grik4Q8BMF5 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Grik4Q8BMF5 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Grik4Q8BMF5 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Grik4Q8BMF5 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Grik4Q8BMF5 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Grik4Q8BMF5 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Grik4Q8BMF5 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Grik4Q8BMF5 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Grik4Q8BMF5 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Grik4Q8BMF5 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Grik4Q8BMF5 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Grik4Q8BMF5 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Grik4Q8BMF5 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Grik4Q8BMF5 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Grik4Q8BMF5 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Grik4Q8BMF5 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Grik4Q8BMF5 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Grik4Q8BMF5 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Grik4Q8BMF5 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Grik4Q8BMF5 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms