Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV1

Gpc2, Glypican-2, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc2Q8BKV1 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gpc2Q8BKV1 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gpc2Q8BKV1 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gpc2Q8BKV1 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gpc2Q8BKV1 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gpc2Q8BKV1 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gpc2Q8BKV1 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gpc2Q8BKV1 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gpc2Q8BKV1 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gpc2Q8BKV1 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gpc2Q8BKV1 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gpc2Q8BKV1 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gpc2Q8BKV1 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gpc2Q8BKV1 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gpc2Q8BKV1 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gpc2Q8BKV1 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gpc2Q8BKV1 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gpc2Q8BKV1 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gpc2Q8BKV1 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gpc2Q8BKV1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gpc2Q8BKV1 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gpc2Q8BKV1 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gpc2Q8BKV1 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gpc2Q8BKV1 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gpc2Q8BKV1 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Gpc2Q8BKV1 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Gpc2Q8BKV1 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gpc2Q8BKV1 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gpc2Q8BKV1 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gpc2Q8BKV1 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Gpc2Q8BKV1 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gpc2Q8BKV1 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gpc2Q8BKV1 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gpc2Q8BKV1 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gpc2Q8BKV1 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gpc2Q8BKV1 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gpc2Q8BKV1 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gpc2Q8BKV1 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gpc2Q8BKV1 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gpc2Q8BKV1 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gpc2Q8BKV1 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gpc2Q8BKV1 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gpc2Q8BKV1 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gpc2Q8BKV1 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gpc2Q8BKV1 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gpc2Q8BKV1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Gpc2Q8BKV1 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gpc2Q8BKV1 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gpc2Q8BKV1 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gpc2Q8BKV1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gpc2Q8BKV1 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gpc2Q8BKV1 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gpc2Q8BKV1 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gpc2Q8BKV1 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gpc2Q8BKV1 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gpc2Q8BKV1 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gpc2Q8BKV1 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gpc2Q8BKV1 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Gpc2Q8BKV1 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gpc2Q8BKV1 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gpc2Q8BKV1 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Gpc2Q8BKV1 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gpc2Q8BKV1 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gpc2Q8BKV1 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Gpc2Q8BKV1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gpc2Q8BKV1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gpc2Q8BKV1 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gpc2Q8BKV1 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gpc2Q8BKV1 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gpc2Q8BKV1 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gpc2Q8BKV1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gpc2Q8BKV1 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gpc2Q8BKV1 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gpc2Q8BKV1 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gpc2Q8BKV1 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gpc2Q8BKV1 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gpc2Q8BKV1 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Gpc2Q8BKV1 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gpc2Q8BKV1 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Gpc2Q8BKV1 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gpc2Q8BKV1 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gpc2Q8BKV1 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gpc2Q8BKV1 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gpc2Q8BKV1 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gpc2Q8BKV1 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gpc2Q8BKV1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gpc2Q8BKV1 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gpc2Q8BKV1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gpc2Q8BKV1 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gpc2Q8BKV1 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gpc2Q8BKV1 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gpc2Q8BKV1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gpc2Q8BKV1 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gpc2Q8BKV1 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gpc2Q8BKV1 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gpc2Q8BKV1 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Gpc2Q8BKV1 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gpc2Q8BKV1 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gpc2Q8BKV1 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gpc2Q8BKV1 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms