Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJL0

Smarcal1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcal1Q8BJL0 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Smarcal1Q8BJL0 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smarcal1Q8BJL0 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smarcal1Q8BJL0 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smarcal1Q8BJL0 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smarcal1Q8BJL0 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smarcal1Q8BJL0 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smarcal1Q8BJL0 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smarcal1Q8BJL0 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Smarcal1Q8BJL0 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smarcal1Q8BJL0 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smarcal1Q8BJL0 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smarcal1Q8BJL0 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smarcal1Q8BJL0 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smarcal1Q8BJL0 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smarcal1Q8BJL0 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smarcal1Q8BJL0 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smarcal1Q8BJL0 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Smarcal1Q8BJL0 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smarcal1Q8BJL0 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smarcal1Q8BJL0 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smarcal1Q8BJL0 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smarcal1Q8BJL0 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smarcal1Q8BJL0 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Smarcal1Q8BJL0 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smarcal1Q8BJL0 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smarcal1Q8BJL0 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smarcal1Q8BJL0 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smarcal1Q8BJL0 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smarcal1Q8BJL0 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smarcal1Q8BJL0 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smarcal1Q8BJL0 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Smarcal1Q8BJL0 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Smarcal1Q8BJL0 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Smarcal1Q8BJL0 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Smarcal1Q8BJL0 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smarcal1Q8BJL0 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smarcal1Q8BJL0 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smarcal1Q8BJL0 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smarcal1Q8BJL0 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smarcal1Q8BJL0 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smarcal1Q8BJL0 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smarcal1Q8BJL0 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smarcal1Q8BJL0 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smarcal1Q8BJL0 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smarcal1Q8BJL0 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smarcal1Q8BJL0 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smarcal1Q8BJL0 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smarcal1Q8BJL0 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smarcal1Q8BJL0 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smarcal1Q8BJL0 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smarcal1Q8BJL0 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smarcal1Q8BJL0 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smarcal1Q8BJL0 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smarcal1Q8BJL0 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smarcal1Q8BJL0 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smarcal1Q8BJL0 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smarcal1Q8BJL0 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smarcal1Q8BJL0 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smarcal1Q8BJL0 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smarcal1Q8BJL0 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smarcal1Q8BJL0 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Smarcal1Q8BJL0 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smarcal1Q8BJL0 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Smarcal1Q8BJL0 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smarcal1Q8BJL0 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smarcal1Q8BJL0 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smarcal1Q8BJL0 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smarcal1Q8BJL0 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smarcal1Q8BJL0 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smarcal1Q8BJL0 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smarcal1Q8BJL0 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smarcal1Q8BJL0 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smarcal1Q8BJL0 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smarcal1Q8BJL0 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smarcal1Q8BJL0 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smarcal1Q8BJL0 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smarcal1Q8BJL0 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smarcal1Q8BJL0 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smarcal1Q8BJL0 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smarcal1Q8BJL0 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smarcal1Q8BJL0 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smarcal1Q8BJL0 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smarcal1Q8BJL0 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smarcal1Q8BJL0 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Smarcal1Q8BJL0 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smarcal1Q8BJL0 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smarcal1Q8BJL0 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smarcal1Q8BJL0 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smarcal1Q8BJL0 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smarcal1Q8BJL0 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smarcal1Q8BJL0 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smarcal1Q8BJL0 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smarcal1Q8BJL0 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smarcal1Q8BJL0 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smarcal1Q8BJL0 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smarcal1Q8BJL0 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smarcal1Q8BJL0 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smarcal1Q8BJL0 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Smarcal1Q8BJL0 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms