Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIJ7

Rufy1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy1Q8BIJ7 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rufy1Q8BIJ7 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rufy1Q8BIJ7 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rufy1Q8BIJ7 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rufy1Q8BIJ7 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rufy1Q8BIJ7 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rufy1Q8BIJ7 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rufy1Q8BIJ7 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rufy1Q8BIJ7 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Rufy1Q8BIJ7 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rufy1Q8BIJ7 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rufy1Q8BIJ7 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rufy1Q8BIJ7 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rufy1Q8BIJ7 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rufy1Q8BIJ7 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rufy1Q8BIJ7 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rufy1Q8BIJ7 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rufy1Q8BIJ7 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rufy1Q8BIJ7 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rufy1Q8BIJ7 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rufy1Q8BIJ7 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rufy1Q8BIJ7 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rufy1Q8BIJ7 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rufy1Q8BIJ7 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rufy1Q8BIJ7 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rufy1Q8BIJ7 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rufy1Q8BIJ7 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rufy1Q8BIJ7 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rufy1Q8BIJ7 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rufy1Q8BIJ7 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Rufy1Q8BIJ7 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rufy1Q8BIJ7 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rufy1Q8BIJ7 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Rufy1Q8BIJ7 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rufy1Q8BIJ7 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rufy1Q8BIJ7 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rufy1Q8BIJ7 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rufy1Q8BIJ7 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rufy1Q8BIJ7 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rufy1Q8BIJ7 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rufy1Q8BIJ7 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rufy1Q8BIJ7 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rufy1Q8BIJ7 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rufy1Q8BIJ7 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rufy1Q8BIJ7 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rufy1Q8BIJ7 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rufy1Q8BIJ7 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rufy1Q8BIJ7 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rufy1Q8BIJ7 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rufy1Q8BIJ7 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rufy1Q8BIJ7 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rufy1Q8BIJ7 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rufy1Q8BIJ7 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rufy1Q8BIJ7 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rufy1Q8BIJ7 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rufy1Q8BIJ7 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rufy1Q8BIJ7 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rufy1Q8BIJ7 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Rufy1Q8BIJ7 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rufy1Q8BIJ7 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rufy1Q8BIJ7 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rufy1Q8BIJ7 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rufy1Q8BIJ7 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rufy1Q8BIJ7 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rufy1Q8BIJ7 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rufy1Q8BIJ7 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rufy1Q8BIJ7 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rufy1Q8BIJ7 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rufy1Q8BIJ7 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rufy1Q8BIJ7 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rufy1Q8BIJ7 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rufy1Q8BIJ7 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rufy1Q8BIJ7 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rufy1Q8BIJ7 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rufy1Q8BIJ7 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Rufy1Q8BIJ7 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rufy1Q8BIJ7 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rufy1Q8BIJ7 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rufy1Q8BIJ7 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rufy1Q8BIJ7 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rufy1Q8BIJ7 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rufy1Q8BIJ7 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rufy1Q8BIJ7 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rufy1Q8BIJ7 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rufy1Q8BIJ7 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rufy1Q8BIJ7 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rufy1Q8BIJ7 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rufy1Q8BIJ7 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rufy1Q8BIJ7 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rufy1Q8BIJ7 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rufy1Q8BIJ7 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rufy1Q8BIJ7 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rufy1Q8BIJ7 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rufy1Q8BIJ7 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rufy1Q8BIJ7 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rufy1Q8BIJ7 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rufy1Q8BIJ7 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Rufy1Q8BIJ7 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rufy1Q8BIJ7 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rufy1Q8BIJ7 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms