Protein–RNA interactions for Protein: Q8BI41

Synb, Syncytin-B, mousemouse

Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynbQ8BI41 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SynbQ8BI41 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SynbQ8BI41 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SynbQ8BI41 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SynbQ8BI41 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SynbQ8BI41 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SynbQ8BI41 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SynbQ8BI41 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SynbQ8BI41 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SynbQ8BI41 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SynbQ8BI41 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SynbQ8BI41 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SynbQ8BI41 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SynbQ8BI41 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SynbQ8BI41 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SynbQ8BI41 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SynbQ8BI41 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SynbQ8BI41 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SynbQ8BI41 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SynbQ8BI41 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SynbQ8BI41 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SynbQ8BI41 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SynbQ8BI41 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SynbQ8BI41 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SynbQ8BI41 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SynbQ8BI41 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SynbQ8BI41 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SynbQ8BI41 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SynbQ8BI41 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SynbQ8BI41 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SynbQ8BI41 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SynbQ8BI41 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SynbQ8BI41 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SynbQ8BI41 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SynbQ8BI41 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SynbQ8BI41 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SynbQ8BI41 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SynbQ8BI41 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SynbQ8BI41 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SynbQ8BI41 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SynbQ8BI41 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SynbQ8BI41 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SynbQ8BI41 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SynbQ8BI41 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SynbQ8BI41 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SynbQ8BI41 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SynbQ8BI41 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SynbQ8BI41 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SynbQ8BI41 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SynbQ8BI41 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SynbQ8BI41 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SynbQ8BI41 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SynbQ8BI41 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SynbQ8BI41 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SynbQ8BI41 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SynbQ8BI41 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SynbQ8BI41 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SynbQ8BI41 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SynbQ8BI41 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SynbQ8BI41 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SynbQ8BI41 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SynbQ8BI41 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SynbQ8BI41 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SynbQ8BI41 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SynbQ8BI41 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SynbQ8BI41 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SynbQ8BI41 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SynbQ8BI41 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SynbQ8BI41 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SynbQ8BI41 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SynbQ8BI41 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SynbQ8BI41 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SynbQ8BI41 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SynbQ8BI41 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SynbQ8BI41 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SynbQ8BI41 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SynbQ8BI41 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SynbQ8BI41 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SynbQ8BI41 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SynbQ8BI41 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SynbQ8BI41 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SynbQ8BI41 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SynbQ8BI41 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SynbQ8BI41 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SynbQ8BI41 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SynbQ8BI41 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SynbQ8BI41 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SynbQ8BI41 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SynbQ8BI41 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SynbQ8BI41 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SynbQ8BI41 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SynbQ8BI41 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SynbQ8BI41 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SynbQ8BI41 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SynbQ8BI41 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SynbQ8BI41 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SynbQ8BI41 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SynbQ8BI41 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SynbQ8BI41 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SynbQ8BI41 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms