Protein–RNA interactions for Protein: Q810M6

Liat1, Protein LIAT1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Liat1Q810M6 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Liat1Q810M6 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Liat1Q810M6 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Liat1Q810M6 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Liat1Q810M6 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Liat1Q810M6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Liat1Q810M6 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Liat1Q810M6 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Liat1Q810M6 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Liat1Q810M6 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Liat1Q810M6 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Liat1Q810M6 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Liat1Q810M6 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Liat1Q810M6 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Liat1Q810M6 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Liat1Q810M6 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Liat1Q810M6 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Liat1Q810M6 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Liat1Q810M6 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Liat1Q810M6 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Liat1Q810M6 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Liat1Q810M6 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Liat1Q810M6 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Liat1Q810M6 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Liat1Q810M6 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Liat1Q810M6 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Liat1Q810M6 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Liat1Q810M6 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Liat1Q810M6 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Liat1Q810M6 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Liat1Q810M6 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Liat1Q810M6 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Liat1Q810M6 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Liat1Q810M6 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Liat1Q810M6 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Liat1Q810M6 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Liat1Q810M6 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Liat1Q810M6 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Liat1Q810M6 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Liat1Q810M6 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Liat1Q810M6 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Liat1Q810M6 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Liat1Q810M6 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Liat1Q810M6 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Liat1Q810M6 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Liat1Q810M6 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Liat1Q810M6 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Liat1Q810M6 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Liat1Q810M6 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Liat1Q810M6 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Liat1Q810M6 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Liat1Q810M6 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Liat1Q810M6 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Liat1Q810M6 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Liat1Q810M6 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Liat1Q810M6 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Liat1Q810M6 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Liat1Q810M6 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Liat1Q810M6 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Liat1Q810M6 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Liat1Q810M6 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Liat1Q810M6 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Liat1Q810M6 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Liat1Q810M6 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Liat1Q810M6 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Liat1Q810M6 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Liat1Q810M6 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Liat1Q810M6 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Liat1Q810M6 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Liat1Q810M6 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Liat1Q810M6 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Liat1Q810M6 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Liat1Q810M6 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Liat1Q810M6 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Liat1Q810M6 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Liat1Q810M6 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Liat1Q810M6 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Liat1Q810M6 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Liat1Q810M6 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Liat1Q810M6 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Liat1Q810M6 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Liat1Q810M6 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Liat1Q810M6 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Liat1Q810M6 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Liat1Q810M6 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Liat1Q810M6 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Liat1Q810M6 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Liat1Q810M6 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Liat1Q810M6 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Liat1Q810M6 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Liat1Q810M6 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Liat1Q810M6 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Liat1Q810M6 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Liat1Q810M6 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Liat1Q810M6 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Liat1Q810M6 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Liat1Q810M6 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Liat1Q810M6 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Liat1Q810M6 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Liat1Q810M6 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms