Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim19Q80ZU4 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim19Q80ZU4 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim19Q80ZU4 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim19Q80ZU4 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim19Q80ZU4 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim19Q80ZU4 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim19Q80ZU4 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim19Q80ZU4 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim19Q80ZU4 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim19Q80ZU4 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim19Q80ZU4 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim19Q80ZU4 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Smim19Q80ZU4 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Smim19Q80ZU4 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Smim19Q80ZU4 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Smim19Q80ZU4 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Smim19Q80ZU4 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Smim19Q80ZU4 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Smim19Q80ZU4 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Smim19Q80ZU4 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Smim19Q80ZU4 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Smim19Q80ZU4 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim19Q80ZU4 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim19Q80ZU4 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim19Q80ZU4 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim19Q80ZU4 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim19Q80ZU4 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim19Q80ZU4 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim19Q80ZU4 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim19Q80ZU4 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim19Q80ZU4 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim19Q80ZU4 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim19Q80ZU4 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim19Q80ZU4 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim19Q80ZU4 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim19Q80ZU4 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim19Q80ZU4 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim19Q80ZU4 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim19Q80ZU4 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim19Q80ZU4 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim19Q80ZU4 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim19Q80ZU4 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim19Q80ZU4 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim19Q80ZU4 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim19Q80ZU4 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim19Q80ZU4 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim19Q80ZU4 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim19Q80ZU4 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim19Q80ZU4 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim19Q80ZU4 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim19Q80ZU4 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim19Q80ZU4 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim19Q80ZU4 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smim19Q80ZU4 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smim19Q80ZU4 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smim19Q80ZU4 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smim19Q80ZU4 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smim19Q80ZU4 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smim19Q80ZU4 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smim19Q80ZU4 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smim19Q80ZU4 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smim19Q80ZU4 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smim19Q80ZU4 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smim19Q80ZU4 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smim19Q80ZU4 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smim19Q80ZU4 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Smim19Q80ZU4 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smim19Q80ZU4 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smim19Q80ZU4 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smim19Q80ZU4 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Smim19Q80ZU4 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smim19Q80ZU4 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smim19Q80ZU4 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smim19Q80ZU4 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smim19Q80ZU4 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smim19Q80ZU4 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smim19Q80ZU4 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smim19Q80ZU4 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smim19Q80ZU4 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smim19Q80ZU4 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smim19Q80ZU4 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smim19Q80ZU4 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smim19Q80ZU4 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smim19Q80ZU4 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smim19Q80ZU4 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smim19Q80ZU4 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smim19Q80ZU4 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smim19Q80ZU4 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smim19Q80ZU4 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smim19Q80ZU4 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smim19Q80ZU4 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smim19Q80ZU4 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smim19Q80ZU4 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smim19Q80ZU4 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smim19Q80ZU4 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Smim19Q80ZU4 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smim19Q80ZU4 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smim19Q80ZU4 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Smim19Q80ZU4 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms