Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z24

Negr1, Neuronal growth regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Negr1Q80Z24 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Negr1Q80Z24 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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