Protein–RNA interactions for Protein: Q80VN0

Cfap100, Cilia- and flagella-associated protein 100, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap100Q80VN0 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cfap100Q80VN0 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cfap100Q80VN0 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cfap100Q80VN0 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cfap100Q80VN0 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cfap100Q80VN0 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Cfap100Q80VN0 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cfap100Q80VN0 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cfap100Q80VN0 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cfap100Q80VN0 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cfap100Q80VN0 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cfap100Q80VN0 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cfap100Q80VN0 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cfap100Q80VN0 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cfap100Q80VN0 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cfap100Q80VN0 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cfap100Q80VN0 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Cfap100Q80VN0 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Cfap100Q80VN0 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cfap100Q80VN0 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cfap100Q80VN0 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cfap100Q80VN0 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cfap100Q80VN0 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cfap100Q80VN0 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cfap100Q80VN0 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cfap100Q80VN0 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cfap100Q80VN0 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cfap100Q80VN0 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cfap100Q80VN0 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cfap100Q80VN0 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cfap100Q80VN0 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cfap100Q80VN0 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cfap100Q80VN0 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cfap100Q80VN0 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cfap100Q80VN0 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cfap100Q80VN0 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cfap100Q80VN0 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cfap100Q80VN0 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cfap100Q80VN0 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cfap100Q80VN0 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cfap100Q80VN0 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cfap100Q80VN0 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cfap100Q80VN0 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cfap100Q80VN0 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cfap100Q80VN0 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cfap100Q80VN0 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cfap100Q80VN0 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cfap100Q80VN0 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cfap100Q80VN0 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cfap100Q80VN0 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cfap100Q80VN0 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cfap100Q80VN0 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cfap100Q80VN0 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Cfap100Q80VN0 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Cfap100Q80VN0 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Cfap100Q80VN0 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cfap100Q80VN0 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cfap100Q80VN0 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cfap100Q80VN0 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cfap100Q80VN0 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cfap100Q80VN0 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cfap100Q80VN0 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cfap100Q80VN0 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cfap100Q80VN0 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cfap100Q80VN0 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cfap100Q80VN0 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cfap100Q80VN0 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cfap100Q80VN0 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Cfap100Q80VN0 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cfap100Q80VN0 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Cfap100Q80VN0 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cfap100Q80VN0 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cfap100Q80VN0 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cfap100Q80VN0 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cfap100Q80VN0 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cfap100Q80VN0 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cfap100Q80VN0 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cfap100Q80VN0 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cfap100Q80VN0 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Cfap100Q80VN0 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cfap100Q80VN0 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cfap100Q80VN0 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cfap100Q80VN0 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cfap100Q80VN0 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cfap100Q80VN0 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cfap100Q80VN0 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cfap100Q80VN0 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cfap100Q80VN0 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cfap100Q80VN0 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cfap100Q80VN0 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cfap100Q80VN0 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cfap100Q80VN0 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cfap100Q80VN0 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cfap100Q80VN0 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cfap100Q80VN0 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cfap100Q80VN0 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cfap100Q80VN0 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cfap100Q80VN0 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cfap100Q80VN0 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cfap100Q80VN0 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms