Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM3

Ttc29, Tetratricopeptide repeat protein 29, mousemouse

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Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc29Q80VM3 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc29Q80VM3 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ttc29Q80VM3 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ttc29Q80VM3 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ttc29Q80VM3 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ttc29Q80VM3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ttc29Q80VM3 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ttc29Q80VM3 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttc29Q80VM3 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttc29Q80VM3 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttc29Q80VM3 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttc29Q80VM3 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttc29Q80VM3 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttc29Q80VM3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttc29Q80VM3 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttc29Q80VM3 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttc29Q80VM3 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttc29Q80VM3 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttc29Q80VM3 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttc29Q80VM3 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttc29Q80VM3 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttc29Q80VM3 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttc29Q80VM3 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttc29Q80VM3 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttc29Q80VM3 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttc29Q80VM3 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttc29Q80VM3 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttc29Q80VM3 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttc29Q80VM3 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttc29Q80VM3 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttc29Q80VM3 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttc29Q80VM3 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttc29Q80VM3 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttc29Q80VM3 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttc29Q80VM3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttc29Q80VM3 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttc29Q80VM3 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttc29Q80VM3 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttc29Q80VM3 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttc29Q80VM3 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttc29Q80VM3 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttc29Q80VM3 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttc29Q80VM3 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttc29Q80VM3 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttc29Q80VM3 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttc29Q80VM3 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttc29Q80VM3 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttc29Q80VM3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttc29Q80VM3 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttc29Q80VM3 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttc29Q80VM3 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttc29Q80VM3 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttc29Q80VM3 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Ttc29Q80VM3 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttc29Q80VM3 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttc29Q80VM3 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttc29Q80VM3 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttc29Q80VM3 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttc29Q80VM3 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttc29Q80VM3 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Ttc29Q80VM3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc29Q80VM3 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc29Q80VM3 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc29Q80VM3 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Ttc29Q80VM3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc29Q80VM3 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc29Q80VM3 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc29Q80VM3 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc29Q80VM3 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc29Q80VM3 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc29Q80VM3 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc29Q80VM3 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc29Q80VM3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc29Q80VM3 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc29Q80VM3 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc29Q80VM3 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc29Q80VM3 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc29Q80VM3 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc29Q80VM3 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc29Q80VM3 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc29Q80VM3 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc29Q80VM3 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc29Q80VM3 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc29Q80VM3 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc29Q80VM3 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc29Q80VM3 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc29Q80VM3 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc29Q80VM3 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc29Q80VM3 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc29Q80VM3 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc29Q80VM3 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc29Q80VM3 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc29Q80VM3 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc29Q80VM3 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc29Q80VM3 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc29Q80VM3 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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