Protein–RNA interactions for Protein: Q80UU2

Rpp38, Ribonuclease P protein subunit p38, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpp38Q80UU2 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpp38Q80UU2 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpp38Q80UU2 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpp38Q80UU2 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpp38Q80UU2 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpp38Q80UU2 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpp38Q80UU2 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpp38Q80UU2 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpp38Q80UU2 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpp38Q80UU2 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpp38Q80UU2 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpp38Q80UU2 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpp38Q80UU2 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpp38Q80UU2 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpp38Q80UU2 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpp38Q80UU2 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpp38Q80UU2 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpp38Q80UU2 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpp38Q80UU2 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpp38Q80UU2 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpp38Q80UU2 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpp38Q80UU2 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpp38Q80UU2 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpp38Q80UU2 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpp38Q80UU2 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpp38Q80UU2 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpp38Q80UU2 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpp38Q80UU2 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpp38Q80UU2 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpp38Q80UU2 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpp38Q80UU2 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpp38Q80UU2 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpp38Q80UU2 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpp38Q80UU2 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpp38Q80UU2 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpp38Q80UU2 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpp38Q80UU2 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Rpp38Q80UU2 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpp38Q80UU2 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpp38Q80UU2 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Rpp38Q80UU2 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpp38Q80UU2 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpp38Q80UU2 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Rpp38Q80UU2 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpp38Q80UU2 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Rpp38Q80UU2 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpp38Q80UU2 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Rpp38Q80UU2 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Rpp38Q80UU2 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Rpp38Q80UU2 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpp38Q80UU2 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpp38Q80UU2 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpp38Q80UU2 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpp38Q80UU2 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpp38Q80UU2 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpp38Q80UU2 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpp38Q80UU2 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpp38Q80UU2 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpp38Q80UU2 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpp38Q80UU2 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpp38Q80UU2 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpp38Q80UU2 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpp38Q80UU2 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpp38Q80UU2 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpp38Q80UU2 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpp38Q80UU2 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpp38Q80UU2 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpp38Q80UU2 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms