Protein–RNA interactions for Protein: Q80U04

Pja2, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-2, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja2Q80U04 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pja2Q80U04 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pja2Q80U04 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pja2Q80U04 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pja2Q80U04 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pja2Q80U04 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pja2Q80U04 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pja2Q80U04 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pja2Q80U04 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pja2Q80U04 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pja2Q80U04 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pja2Q80U04 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pja2Q80U04 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pja2Q80U04 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pja2Q80U04 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pja2Q80U04 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pja2Q80U04 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pja2Q80U04 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pja2Q80U04 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pja2Q80U04 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pja2Q80U04 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pja2Q80U04 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pja2Q80U04 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pja2Q80U04 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pja2Q80U04 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pja2Q80U04 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pja2Q80U04 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pja2Q80U04 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pja2Q80U04 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pja2Q80U04 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pja2Q80U04 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pja2Q80U04 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pja2Q80U04 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pja2Q80U04 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pja2Q80U04 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Pja2Q80U04 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pja2Q80U04 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pja2Q80U04 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pja2Q80U04 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pja2Q80U04 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pja2Q80U04 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pja2Q80U04 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pja2Q80U04 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pja2Q80U04 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pja2Q80U04 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pja2Q80U04 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pja2Q80U04 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pja2Q80U04 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pja2Q80U04 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pja2Q80U04 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pja2Q80U04 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pja2Q80U04 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pja2Q80U04 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pja2Q80U04 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pja2Q80U04 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pja2Q80U04 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pja2Q80U04 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pja2Q80U04 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pja2Q80U04 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pja2Q80U04 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pja2Q80U04 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pja2Q80U04 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pja2Q80U04 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pja2Q80U04 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pja2Q80U04 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pja2Q80U04 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pja2Q80U04 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pja2Q80U04 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pja2Q80U04 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pja2Q80U04 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pja2Q80U04 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pja2Q80U04 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pja2Q80U04 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pja2Q80U04 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pja2Q80U04 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pja2Q80U04 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pja2Q80U04 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pja2Q80U04 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Pja2Q80U04 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pja2Q80U04 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pja2Q80U04 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pja2Q80U04 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pja2Q80U04 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pja2Q80U04 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pja2Q80U04 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pja2Q80U04 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pja2Q80U04 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pja2Q80U04 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pja2Q80U04 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pja2Q80U04 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pja2Q80U04 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pja2Q80U04 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pja2Q80U04 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pja2Q80U04 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pja2Q80U04 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pja2Q80U04 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pja2Q80U04 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pja2Q80U04 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pja2Q80U04 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pja2Q80U04 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms