Protein–RNA interactions for Protein: Q80TJ7

Phf8, Histone lysine demethylase PHF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf8Q80TJ7 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Phf8Q80TJ7 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Phf8Q80TJ7 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Phf8Q80TJ7 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Phf8Q80TJ7 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Phf8Q80TJ7 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Phf8Q80TJ7 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Phf8Q80TJ7 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Phf8Q80TJ7 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Phf8Q80TJ7 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Phf8Q80TJ7 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Phf8Q80TJ7 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Phf8Q80TJ7 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Phf8Q80TJ7 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Phf8Q80TJ7 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Phf8Q80TJ7 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Phf8Q80TJ7 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Phf8Q80TJ7 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Phf8Q80TJ7 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Phf8Q80TJ7 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Phf8Q80TJ7 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Phf8Q80TJ7 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Phf8Q80TJ7 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Phf8Q80TJ7 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Phf8Q80TJ7 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Phf8Q80TJ7 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Phf8Q80TJ7 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Phf8Q80TJ7 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Phf8Q80TJ7 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Phf8Q80TJ7 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Phf8Q80TJ7 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Phf8Q80TJ7 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Phf8Q80TJ7 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Phf8Q80TJ7 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Phf8Q80TJ7 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Phf8Q80TJ7 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Phf8Q80TJ7 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Phf8Q80TJ7 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Phf8Q80TJ7 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Phf8Q80TJ7 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Phf8Q80TJ7 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Phf8Q80TJ7 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Phf8Q80TJ7 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Phf8Q80TJ7 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Phf8Q80TJ7 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Phf8Q80TJ7 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Phf8Q80TJ7 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Phf8Q80TJ7 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Phf8Q80TJ7 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Phf8Q80TJ7 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Phf8Q80TJ7 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Phf8Q80TJ7 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Phf8Q80TJ7 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Phf8Q80TJ7 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Phf8Q80TJ7 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Phf8Q80TJ7 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Phf8Q80TJ7 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Phf8Q80TJ7 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Phf8Q80TJ7 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Phf8Q80TJ7 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Phf8Q80TJ7 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Phf8Q80TJ7 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Phf8Q80TJ7 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Phf8Q80TJ7 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Phf8Q80TJ7 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Phf8Q80TJ7 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Phf8Q80TJ7 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Phf8Q80TJ7 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Phf8Q80TJ7 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Phf8Q80TJ7 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Phf8Q80TJ7 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Phf8Q80TJ7 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Phf8Q80TJ7 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Phf8Q80TJ7 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Phf8Q80TJ7 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Phf8Q80TJ7 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Phf8Q80TJ7 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Phf8Q80TJ7 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Phf8Q80TJ7 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Phf8Q80TJ7 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Phf8Q80TJ7 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Phf8Q80TJ7 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Phf8Q80TJ7 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Phf8Q80TJ7 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phf8Q80TJ7 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phf8Q80TJ7 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phf8Q80TJ7 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phf8Q80TJ7 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phf8Q80TJ7 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phf8Q80TJ7 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phf8Q80TJ7 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phf8Q80TJ7 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phf8Q80TJ7 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phf8Q80TJ7 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phf8Q80TJ7 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phf8Q80TJ7 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phf8Q80TJ7 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phf8Q80TJ7 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phf8Q80TJ7 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phf8Q80TJ7 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms