Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dsg1cQ7TSF0 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms