Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS58

Clec4b1, Antigen presenting cell lectin-like receptor A2, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec4b1Q7TS58 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clec4b1Q7TS58 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clec4b1Q7TS58 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clec4b1Q7TS58 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clec4b1Q7TS58 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clec4b1Q7TS58 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clec4b1Q7TS58 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clec4b1Q7TS58 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clec4b1Q7TS58 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clec4b1Q7TS58 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Clec4b1Q7TS58 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clec4b1Q7TS58 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clec4b1Q7TS58 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clec4b1Q7TS58 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clec4b1Q7TS58 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clec4b1Q7TS58 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clec4b1Q7TS58 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clec4b1Q7TS58 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clec4b1Q7TS58 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clec4b1Q7TS58 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clec4b1Q7TS58 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clec4b1Q7TS58 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clec4b1Q7TS58 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clec4b1Q7TS58 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clec4b1Q7TS58 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clec4b1Q7TS58 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clec4b1Q7TS58 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clec4b1Q7TS58 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clec4b1Q7TS58 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clec4b1Q7TS58 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clec4b1Q7TS58 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clec4b1Q7TS58 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clec4b1Q7TS58 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clec4b1Q7TS58 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clec4b1Q7TS58 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clec4b1Q7TS58 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clec4b1Q7TS58 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clec4b1Q7TS58 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Clec4b1Q7TS58 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Clec4b1Q7TS58 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clec4b1Q7TS58 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clec4b1Q7TS58 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clec4b1Q7TS58 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clec4b1Q7TS58 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms