Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Shq1Q7TMX5 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Shq1Q7TMX5 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Shq1Q7TMX5 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Shq1Q7TMX5 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Shq1Q7TMX5 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Shq1Q7TMX5 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Shq1Q7TMX5 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Shq1Q7TMX5 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Shq1Q7TMX5 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Shq1Q7TMX5 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Shq1Q7TMX5 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Shq1Q7TMX5 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Shq1Q7TMX5 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Shq1Q7TMX5 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Shq1Q7TMX5 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Shq1Q7TMX5 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Shq1Q7TMX5 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Shq1Q7TMX5 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Shq1Q7TMX5 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Shq1Q7TMX5 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Shq1Q7TMX5 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Shq1Q7TMX5 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Shq1Q7TMX5 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Shq1Q7TMX5 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Shq1Q7TMX5 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Shq1Q7TMX5 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Shq1Q7TMX5 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Shq1Q7TMX5 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Shq1Q7TMX5 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Shq1Q7TMX5 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Shq1Q7TMX5 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Shq1Q7TMX5 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Shq1Q7TMX5 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Shq1Q7TMX5 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Shq1Q7TMX5 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Shq1Q7TMX5 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Shq1Q7TMX5 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Shq1Q7TMX5 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Shq1Q7TMX5 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Shq1Q7TMX5 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Shq1Q7TMX5 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Shq1Q7TMX5 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Shq1Q7TMX5 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Shq1Q7TMX5 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Shq1Q7TMX5 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Shq1Q7TMX5 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Shq1Q7TMX5 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Shq1Q7TMX5 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Shq1Q7TMX5 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Shq1Q7TMX5 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Shq1Q7TMX5 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Shq1Q7TMX5 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Shq1Q7TMX5 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Shq1Q7TMX5 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC23■■□□□ 1.27
Shq1Q7TMX5 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Shq1Q7TMX5 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Shq1Q7TMX5 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Shq1Q7TMX5 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Shq1Q7TMX5 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Shq1Q7TMX5 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Shq1Q7TMX5 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Shq1Q7TMX5 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Shq1Q7TMX5 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Shq1Q7TMX5 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Shq1Q7TMX5 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Shq1Q7TMX5 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Shq1Q7TMX5 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Shq1Q7TMX5 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Shq1Q7TMX5 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Shq1Q7TMX5 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Shq1Q7TMX5 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Shq1Q7TMX5 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Shq1Q7TMX5 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Shq1Q7TMX5 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Shq1Q7TMX5 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Shq1Q7TMX5 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Shq1Q7TMX5 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Shq1Q7TMX5 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Shq1Q7TMX5 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Shq1Q7TMX5 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Shq1Q7TMX5 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Shq1Q7TMX5 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Shq1Q7TMX5 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Shq1Q7TMX5 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Shq1Q7TMX5 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Shq1Q7TMX5 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Shq1Q7TMX5 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Shq1Q7TMX5 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Shq1Q7TMX5 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Shq1Q7TMX5 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Shq1Q7TMX5 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Shq1Q7TMX5 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Shq1Q7TMX5 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Shq1Q7TMX5 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Shq1Q7TMX5 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Shq1Q7TMX5 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Shq1Q7TMX5 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Shq1Q7TMX5 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Shq1Q7TMX5 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms