Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMV1

Rnf139, E3 ubiquitin-protein ligase RNF139, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf139Q7TMV1 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnf139Q7TMV1 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnf139Q7TMV1 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnf139Q7TMV1 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Rnf139Q7TMV1 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Rnf139Q7TMV1 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Rnf139Q7TMV1 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Rnf139Q7TMV1 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Rnf139Q7TMV1 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnf139Q7TMV1 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnf139Q7TMV1 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnf139Q7TMV1 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnf139Q7TMV1 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnf139Q7TMV1 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnf139Q7TMV1 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnf139Q7TMV1 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnf139Q7TMV1 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnf139Q7TMV1 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnf139Q7TMV1 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnf139Q7TMV1 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnf139Q7TMV1 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnf139Q7TMV1 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnf139Q7TMV1 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnf139Q7TMV1 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnf139Q7TMV1 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnf139Q7TMV1 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnf139Q7TMV1 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnf139Q7TMV1 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnf139Q7TMV1 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnf139Q7TMV1 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnf139Q7TMV1 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnf139Q7TMV1 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf139Q7TMV1 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf139Q7TMV1 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf139Q7TMV1 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf139Q7TMV1 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf139Q7TMV1 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf139Q7TMV1 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf139Q7TMV1 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf139Q7TMV1 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf139Q7TMV1 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf139Q7TMV1 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf139Q7TMV1 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf139Q7TMV1 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf139Q7TMV1 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf139Q7TMV1 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf139Q7TMV1 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf139Q7TMV1 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf139Q7TMV1 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf139Q7TMV1 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf139Q7TMV1 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf139Q7TMV1 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf139Q7TMV1 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf139Q7TMV1 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf139Q7TMV1 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnf139Q7TMV1 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnf139Q7TMV1 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnf139Q7TMV1 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnf139Q7TMV1 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnf139Q7TMV1 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnf139Q7TMV1 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnf139Q7TMV1 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnf139Q7TMV1 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnf139Q7TMV1 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnf139Q7TMV1 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnf139Q7TMV1 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnf139Q7TMV1 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnf139Q7TMV1 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnf139Q7TMV1 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnf139Q7TMV1 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnf139Q7TMV1 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf139Q7TMV1 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf139Q7TMV1 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf139Q7TMV1 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf139Q7TMV1 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf139Q7TMV1 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf139Q7TMV1 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf139Q7TMV1 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf139Q7TMV1 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf139Q7TMV1 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf139Q7TMV1 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf139Q7TMV1 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf139Q7TMV1 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf139Q7TMV1 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf139Q7TMV1 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf139Q7TMV1 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf139Q7TMV1 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf139Q7TMV1 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf139Q7TMV1 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf139Q7TMV1 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf139Q7TMV1 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf139Q7TMV1 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf139Q7TMV1 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf139Q7TMV1 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf139Q7TMV1 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf139Q7TMV1 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf139Q7TMV1 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf139Q7TMV1 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf139Q7TMV1 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf139Q7TMV1 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms