Protein–RNA interactions for Protein: Q78T54

Vma21, Vacuolar ATPase assembly integral membrane protein Vma21, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vma21Q78T54 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vma21Q78T54 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vma21Q78T54 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Vma21Q78T54 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vma21Q78T54 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vma21Q78T54 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vma21Q78T54 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Vma21Q78T54 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vma21Q78T54 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
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Vma21Q78T54 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Vma21Q78T54 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vma21Q78T54 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vma21Q78T54 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vma21Q78T54 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vma21Q78T54 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vma21Q78T54 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vma21Q78T54 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vma21Q78T54 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vma21Q78T54 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vma21Q78T54 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vma21Q78T54 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Vma21Q78T54 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Vma21Q78T54 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Vma21Q78T54 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Vma21Q78T54 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Vma21Q78T54 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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