Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWV7

Rpl35, 60S ribosomal protein L35, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl35Q6ZWV7 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpl35Q6ZWV7 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl35Q6ZWV7 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl35Q6ZWV7 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl35Q6ZWV7 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl35Q6ZWV7 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl35Q6ZWV7 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl35Q6ZWV7 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl35Q6ZWV7 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl35Q6ZWV7 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl35Q6ZWV7 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl35Q6ZWV7 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl35Q6ZWV7 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl35Q6ZWV7 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl35Q6ZWV7 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl35Q6ZWV7 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl35Q6ZWV7 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl35Q6ZWV7 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl35Q6ZWV7 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl35Q6ZWV7 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl35Q6ZWV7 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl35Q6ZWV7 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl35Q6ZWV7 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl35Q6ZWV7 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl35Q6ZWV7 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl35Q6ZWV7 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl35Q6ZWV7 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl35Q6ZWV7 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl35Q6ZWV7 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl35Q6ZWV7 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl35Q6ZWV7 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl35Q6ZWV7 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl35Q6ZWV7 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl35Q6ZWV7 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl35Q6ZWV7 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl35Q6ZWV7 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl35Q6ZWV7 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl35Q6ZWV7 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl35Q6ZWV7 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl35Q6ZWV7 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl35Q6ZWV7 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl35Q6ZWV7 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl35Q6ZWV7 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl35Q6ZWV7 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl35Q6ZWV7 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl35Q6ZWV7 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl35Q6ZWV7 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl35Q6ZWV7 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl35Q6ZWV7 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl35Q6ZWV7 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl35Q6ZWV7 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl35Q6ZWV7 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl35Q6ZWV7 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl35Q6ZWV7 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl35Q6ZWV7 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl35Q6ZWV7 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl35Q6ZWV7 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl35Q6ZWV7 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl35Q6ZWV7 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl35Q6ZWV7 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl35Q6ZWV7 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl35Q6ZWV7 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl35Q6ZWV7 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl35Q6ZWV7 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl35Q6ZWV7 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl35Q6ZWV7 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl35Q6ZWV7 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl35Q6ZWV7 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl35Q6ZWV7 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl35Q6ZWV7 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl35Q6ZWV7 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl35Q6ZWV7 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl35Q6ZWV7 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl35Q6ZWV7 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl35Q6ZWV7 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl35Q6ZWV7 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl35Q6ZWV7 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl35Q6ZWV7 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl35Q6ZWV7 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl35Q6ZWV7 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl35Q6ZWV7 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl35Q6ZWV7 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl35Q6ZWV7 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl35Q6ZWV7 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl35Q6ZWV7 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl35Q6ZWV7 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl35Q6ZWV7 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl35Q6ZWV7 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl35Q6ZWV7 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl35Q6ZWV7 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl35Q6ZWV7 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl35Q6ZWV7 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl35Q6ZWV7 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl35Q6ZWV7 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl35Q6ZWV7 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpl35Q6ZWV7 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpl35Q6ZWV7 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpl35Q6ZWV7 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpl35Q6ZWV7 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpl35Q6ZWV7 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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