Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ58

Larp1, La-related protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,072 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Larp1Q6ZQ58 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Larp1Q6ZQ58 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Larp1Q6ZQ58 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Larp1Q6ZQ58 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Larp1Q6ZQ58 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Larp1Q6ZQ58 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Larp1Q6ZQ58 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Larp1Q6ZQ58 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Larp1Q6ZQ58 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Larp1Q6ZQ58 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Larp1Q6ZQ58 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Larp1Q6ZQ58 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Larp1Q6ZQ58 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Larp1Q6ZQ58 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Larp1Q6ZQ58 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Larp1Q6ZQ58 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Larp1Q6ZQ58 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Larp1Q6ZQ58 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Larp1Q6ZQ58 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Larp1Q6ZQ58 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Larp1Q6ZQ58 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Larp1Q6ZQ58 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Larp1Q6ZQ58 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Larp1Q6ZQ58 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Larp1Q6ZQ58 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Larp1Q6ZQ58 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Larp1Q6ZQ58 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Larp1Q6ZQ58 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Larp1Q6ZQ58 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Larp1Q6ZQ58 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Larp1Q6ZQ58 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Larp1Q6ZQ58 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Larp1Q6ZQ58 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Larp1Q6ZQ58 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Larp1Q6ZQ58 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Larp1Q6ZQ58 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Larp1Q6ZQ58 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Larp1Q6ZQ58 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Larp1Q6ZQ58 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Larp1Q6ZQ58 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Larp1Q6ZQ58 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Larp1Q6ZQ58 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Larp1Q6ZQ58 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Larp1Q6ZQ58 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Larp1Q6ZQ58 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Larp1Q6ZQ58 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Larp1Q6ZQ58 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Larp1Q6ZQ58 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Larp1Q6ZQ58 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Larp1Q6ZQ58 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Larp1Q6ZQ58 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Larp1Q6ZQ58 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Larp1Q6ZQ58 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Larp1Q6ZQ58 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Larp1Q6ZQ58 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Larp1Q6ZQ58 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Larp1Q6ZQ58 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Larp1Q6ZQ58 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Larp1Q6ZQ58 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Larp1Q6ZQ58 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Larp1Q6ZQ58 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Larp1Q6ZQ58 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Larp1Q6ZQ58 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Larp1Q6ZQ58 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Larp1Q6ZQ58 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Larp1Q6ZQ58 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Larp1Q6ZQ58 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Larp1Q6ZQ58 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Larp1Q6ZQ58 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Larp1Q6ZQ58 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Larp1Q6ZQ58 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Larp1Q6ZQ58 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Larp1Q6ZQ58 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Larp1Q6ZQ58 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Larp1Q6ZQ58 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Larp1Q6ZQ58 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Larp1Q6ZQ58 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Larp1Q6ZQ58 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Larp1Q6ZQ58 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Larp1Q6ZQ58 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Larp1Q6ZQ58 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Larp1Q6ZQ58 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Larp1Q6ZQ58 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Larp1Q6ZQ58 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Larp1Q6ZQ58 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Larp1Q6ZQ58 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Larp1Q6ZQ58 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Larp1Q6ZQ58 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Larp1Q6ZQ58 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Larp1Q6ZQ58 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Larp1Q6ZQ58 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Larp1Q6ZQ58 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Larp1Q6ZQ58 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Larp1Q6ZQ58 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Larp1Q6ZQ58 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Larp1Q6ZQ58 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Larp1Q6ZQ58 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Larp1Q6ZQ58 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Larp1Q6ZQ58 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Larp1Q6ZQ58 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms